基因页：NCKAP1
概括？
| 基因 | 10787 |
| 象征 | NCKAP1 |
| 同义词 | hem2 | nap1 | nap125 | p125nap1 |
| 描述 | NCK相关蛋白1 |
| 参考 | MIM：604891|HGNC：HGNC：7666|Ensembl：ENSG0000000061676|HPRD：05353|Vega：Otthumg00000132623 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q32 |
| Pascal P值 | 0.05 |
| Sherlock P值 | 0.386 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN g2cdb.human_synaptosom g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG05157266 | 2 | 183901614 | NCKAP1 | 3.73E-5 | 0.604 | 0.02 | DMG：Wockner_2014 |
| CG08668909 | 2 | 183903412 | NCKAP1 | 5.09e-9 | -0.016 | 2.89E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| yipf3 | 0.92 | 0.93 |
| LRRC41 | 0.92 | 0.92 |
| 鸽子 | 0.91 | 0.89 |
| ddost | 0.91 | 0.90 |
| RPN2 | 0.91 | 0.91 |
| CSNK2B | 0.90 | 0.90 |
| 杜拉德 | 0.90 | 0.91 |
| 动作 | 0.89 | 0.87 |
| MAGED1 | 0.89 | 0.89 |
| SCAMP3 | 0.89 | 0.89 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.27 | -0.74 | -0.81 |
| AF347015.8 | -0.74 | -0.82 |
| MT-CO2 | -0.73 | -0.79 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.77 |
| AF347015.33 | -0.71 | -0.78 |
| mt-cyb | -0.71 | -0.78 |
| AF347015.15 | -0.69 | -0.77 |
| AF347015.21 | -0.69 | -0.81 |
| AF347015.2 | -0.69 | -0.78 |
| AF347015.26 | -0.68 | -0.80 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 11418237|15294869|17353931 |
|
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007417 | 中枢神经系统发展 | 塔斯 | 大脑（GO期限：6） | 10673335 |
| 去：0006915 | 凋亡 | 塔斯 | 10673335 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0042995 | 细胞投影 | IEA | Axon（GO术语级别：4） | - |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Actiny Pathway | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Ecadherin新生AJ途径 | 39 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ERBB1下游途径 | 105 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PDGFRB途径 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Ecadherin稳定途径 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Rac1途径 | 54 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| igarashi atf4靶向dn | 90 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MET的Seiden肿瘤发生 | 88 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wood EBV EBNA1靶向 | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 | 283 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amit EGF响应60 HELA | 46 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim生发中心T助手 | 66 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Goldrath免疫记忆 | 65 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MariaDason对姜黄素Sulindac 7的反应 | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kamikubo Myeloid MN1网络 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |