Gene Page:MTHFD2

概括?
GeneID 10797
Symbol MTHFD2
Synonyms NMDMC
Description methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase
Reference MIM:604887|HGNC:HGNC:7434|Ensembl:ENSG00000065911|HPRD:05351|Vega:OTTHUMG00000129814
Gene type protein-coding
Map location 2p13.1
Pascal p-value 0.044
Sherlock P值 0.371
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs643990 chr1 77108637 MTHFD2 10797 0.17 trans
RS16999761 chr4 107454800 MTHFD2 10797 0.1 trans
rs7754123 chr6 132667231 MTHFD2 10797 0.09 trans
rs16944600 chr17 11245098 MTHFD2 10797 0.06 trans
rs8072151 chr17 50228268 MTHFD2 10797 0.15 trans
rs165126 chr18 75358831 MTHFD2 10797 0.16 trans
rs16982879 chrX 92924110 MTHFD2 10797 0.05 trans
rs7879274 chrX 145592957 MTHFD2 10797 0 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
PIP4K2C 0.93 0.88
MAPK9 0.93 0.94
NPTN 0.93 0.94
CAP2 0.93 0.90
NLK 0.92 0.91
NDRG3 0.92 0.94
NMT1 0.92 0.90
HTR5A 0.92 0.91
PI4KA 0.92 0.88
ATP6V0A1 0.92 0.94
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
Bcl7c -0.50 -0.56
RAB13 -0.47 -0.55
GTF3C6 -0.45 -0.42
RAB34 -0.44 -0.48
NSBP1 -0.44 -0.50
DBI -0.42 -0.45
NME4 -0.42 -0.55
AC006276.2 -0.42 -0.42
C9orf46 -0.42 -0.41
RP9P -0.42 -0.49

V.途径注释

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
KEGG乙醛酸盐和二羧酸二羧酸盐代谢 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg fule一个碳池 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU PROSTATE CANCER UP 96 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 UP 146 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS RED UP 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 24HR DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION UP 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED UP 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 3 UP 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TERAMOTO OPN TARGETS CLUSTER 7 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIRMEIER LMP1 RESPONSE LATE UP 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CEBALLOS TARGETS OF TP53 AND MYC UP 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 DN 156 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIAO METASTASIS 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR UP 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOTZMANN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori前BI淋巴细胞向上 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI不成熟的B淋巴细胞DN 90 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI MATURE B LYMPHOCYTE DN 75 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PTCH1和Sufu的Lee目标 53 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG LEUCINE DEPRIVATION UP 142 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMITH TERT TARGETS UP 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jechlinger上皮到间充质转变 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC TGFA UP 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ASTON MAJOR DEPRESSIVE DISORDER UP 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHIPP DLBCL VS FOLLICULAR LYMPHOMA UP 45 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHATTACHARYA EMBRYONIC STEM CELL 89 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN MULTIPLE MYELOMA CD1 VS CD2 UP 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THEILGAARD NEUTROPHIL AT SKIN WOUND UP 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AFFAR YY1 TARGETS DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nguyen Notch1靶向DN 86 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C8 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS MATURE CELL 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德斯癌元签名 64 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU GENOTOXIC DAMAGE 24HR 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen lvad支持失败的心 103 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHODES UNDIFFERENTIATED CANCER 69 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 18HR UP 178 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向 113 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU GENOTOXIC DAMAGE 4HR 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tseng成脂潜力 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES UP 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR UP 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE UP 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG MITOCHONDRIA GENE MODULE 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG GLIOBLASTOMA PLASTICITY UP 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR UP 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHATI G2M ARREST BY 2METHOXYESTRADIOL DN 127 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB UP 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA MITOCHONDRIA 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOLDRATH ANTIGEN RESPONSE 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEDDEN LUNG CANCER POOR SURVIVAL A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MELLMAN TUT1 TARGETS UP 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEN METABOLIC SYNDROM NETWORK 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG EMBRYONIC STEM CELL CORE 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 8 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS CONFLUENT 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS UP 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE LATE 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELPUECH FOXO3 TARGETS DN 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PURBEY TARGETS OF CTBP1 NOT SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUANG GATA2 TARGETS DN 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS UP 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER KDM1A TARGETS DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL DN 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因