基因页:9月9日
概括?
基因 | 10801 |
象征 | 9月9日 |
同义词 | af17q25 | msf | msf1 | napb | pnutl4 | sint1 | septd1 |
描述 | 9月9日 |
参考 | MIM:604061|HGNC:HGNC:7323|ENSEMBL:ENSG00000184640|HPRD:10360|Vega:Otthumg00000177327 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17Q25 |
Pascal P值 | 0.177 |
Sherlock P值 | 0.993 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 蛋白质聚类 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG23716141 | 17 | 75360477 | 9月9日 | 3.824e-4 | 0.414 | 0.043 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1578978 | CHR8 | 118196802 | 9月9日 | 10801 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SEPT9_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C3orf38 | 0.92 | 0.91 |
ube2n | 0.92 | 0.90 |
ube2d3 | 0.91 | 0.91 |
hnrpll | 0.91 | 0.90 |
HSPA13 | 0.91 | 0.90 |
ptges3 | 0.91 | 0.89 |
tiprl | 0.91 | 0.89 |
是的 | 0.90 | 0.88 |
DR1 | 0.90 | 0.89 |
mobkl3 | 0.90 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.67 | -0.71 |
AF347015.33 | -0.65 | -0.70 |
mt-cyb | -0.64 | -0.70 |
FXYD1 | -0.63 | -0.72 |
AF347015.26 | -0.63 | -0.69 |
AF347015.31 | -0.63 | -0.69 |
AF347015.8 | -0.63 | -0.70 |
higd1b | -0.62 | -0.70 |
AF347015.2 | -0.62 | -0.67 |
AC018755.7 | -0.61 | -0.67 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Corre多发性骨髓瘤 | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向12小时 | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇3 DN | 229 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG UP | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BCR ABL1融合的klein目标 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LUI甲状腺癌簇1 | 51 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
威廉姆斯ESR2瞄准 | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TP53和TP73的SCIAN细胞周期目标 | 9 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应480 HELA | 164 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西葫芦转移DN | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1定位DN的Alcalay AML | 184 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Delta FOSB目标2WK | 48 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 | 111 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jiang Tip30目标DN | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
setlur前列腺癌TMPRSS2 ERG融合 | 67 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤MS DN | 46 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SPI1和FLI1 DN的Juban目标 | 92 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |