概括
基因 10801
象征 9月9日
同义词 af17q25 | msf | msf1 | napb | pnutl4 | sint1 | septd1
描述 9月9日
参考 MIM:604061|HGNC:HGNC:7323|ENSEMBL:ENSG00000184640|HPRD:10360|Vega:Otthumg00000177327
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17Q25
Pascal P值 0.177
Sherlock P值 0.993
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 蛋白质聚类
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG23716141 17 75360477 9月9日 3.824e-4 0.414 0.043 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1578978 CHR8 118196802 9月9日 10801 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C3orf38 0.92 0.91
ube2n 0.92 0.90
ube2d3 0.91 0.91
hnrpll 0.91 0.90
HSPA13 0.91 0.90
ptges3 0.91 0.89
tiprl 0.91 0.89
是的 0.90 0.88
DR1 0.90 0.89
mobkl3 0.90 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.67 -0.71
AF347015.33 -0.65 -0.70
mt-cyb -0.64 -0.70
FXYD1 -0.63 -0.72
AF347015.26 -0.63 -0.69
AF347015.31 -0.63 -0.69
AF347015.8 -0.63 -0.70
higd1b -0.62 -0.70
AF347015.2 -0.62 -0.67
AC018755.7 -0.61 -0.67

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Corre多发性骨髓瘤 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向12小时 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮增强 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG UP 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BCR ABL1融合的klein目标 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌簇1 51 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
威廉姆斯ESR2瞄准 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TP53和TP73的SCIAN细胞周期目标 9 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应480 HELA 164 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西葫芦转移DN 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Delta FOSB目标2WK 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jiang Tip30目标DN 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
setlur前列腺癌TMPRSS2 ERG融合 67 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤MS DN 46 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPI1和FLI1 DN的Juban目标 92 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因