基因页面:GJB6
总结吗?
| GeneID | 10804年 |
| 象征 | GJB6 |
| 同义词 | CX30 | DFNA3 | DFNA3B | DFNB1B | ECTD2 | ED2 |电火花强化| HED | HED2 |
| 描述 | 缝隙连接蛋白β6 |
| 参考 | MIM: 604418|HGNC: HGNC: 4288|运用:ENSG00000121742|HPRD: 05107|织女:OTTHUMG00000016515 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 13日12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.365 |
| 胎儿β | -3.059 |
| DMG | 2(#研究) |
| eGene | 小脑 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg25369560 | 13 | 20806543 | GJB6 | 4.57 e - | -0.295 | 0.006 | DMG: Wockner_2014 |
| cg22377389 | 13 | 20805679 | GJB6 | -0.023 | 0.55 | DMG: Nishioka_2013 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TRIM27 | 0.94 | 0.95 |
| PJA1 | 0.94 | 0.94 |
| C7orf70 | 0.94 | 0.94 |
| HN1 | 0.93 | 0.94 |
| ACTR1A | 0.93 | 0.92 |
| CRMP1 | 0.93 | 0.97 |
| TUBB | 0.92 | 0.95 |
| C12orf41 | 0.92 | 0.92 |
| EFTUD2 | 0.92 | 0.93 |
| TTLL1 | 0.92 | 0.93 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.33 | -0.80 | -0.89 |
| MT-CO2 | -0.80 | -0.89 |
| AIFM3 | -0.79 | -0.82 |
| AF347015.31 | -0.79 | -0.87 |
| HEPN1 | -0.79 | -0.83 |
| HLA-F | -0.79 | -0.82 |
| FXYD1 | -0.78 | -0.88 |
| AF347015.27 | -0.78 | -0.88 |
| MT-CYB | -0.78 | -0.87 |
| TSC22D4 | -0.77 | -0.84 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME膜贩运 | 129年 | 74年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME缝隙连接贩卖 | 27 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME缝隙连接组装 | 18 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 森古普塔和LMP1鼻咽癌 | 408年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化和管理不善的DN | 382年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DURCHDEWALD皮肤致癌DN | 264年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 近藤H3K27ME3前列腺癌 | 196年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1目标了 | 673年 | 430年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯DN TP53的目标 | 593年 | 372年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1和TP53目标DN | 591年 | 366年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP | 536年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 | 590年 | 403年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 菲格罗亚AML甲基化集群3 | 170年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过TP53棕熊短波紫外线反应B组 | 549年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |