Gene Page:HSPH1

概括?
GeneID 10808
Symbol HSPH1
Synonyms HSP105|HSP105A|HSP105B|NY-CO-25
Description heat shock protein family H (Hsp110) member 1
参考 MIM：610703|HGNC:HGNC:16969|Ensembl:ENSG00000120694|HPRD:09990|Vega：Otthumg0000000016685
Gene type protein-coding
Map location 13Q12.3
Pascal p-value 0.043
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
Support RNA AND PROTEIN SYNTHESIS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.humanPSD
G2Cdb.humanPSP
COMPOSITESET
Ascano FMRP targets

数据源中的基因
基因集合name Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs17076954 chr13 32516173 HSPH1 10808 0.02 cis
rs6049703 chr20 24432425 HSPH1 10808 0.04 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
FBXL16 0.89 0.92
CYP46A1 0.87 0.82
FAM102A 0.86 0.85
SLC25A23 0.86 0.89
ANKRD43 0.85 0.85
SAPS1 0.84 0.88
AC105206.1 0.84 0.86
STIM1 0.84 0.83
RP5-1187M17.1 0.83 0.87
INF2 0.83 0.81
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
RBMX2 -0.51 -0.57
Dynlt1 -0.49 -0.60
C9orf46 -0.49 -0.56
TUBB2B -0.48 -0.50
EXOSC8 -0.48 -0.49
KIAA1949 -0.48 -0.39
YBX1 -0.47 -0.40
IDH1 -0.47 -0.39
RPS8 -0.47 -0.52
HEBP2 -0.46 -0.61

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
GO:0005524 ATP binding IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006986 对展开蛋白的反应 塔斯 9931472
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005737 细胞质 塔斯 9931472

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
HOLLMANN APOPTOSIS VIA CD40 UP 201 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOANE RESPONSE TO ANDROGEN UP 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS BLUE UP 136 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 24HR DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 8HR UP 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 12HR UP 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA DN 146 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HIF1A TARGETS UP 67 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge HIF1A和HIF2A靶向 41 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOINUMA COLON CANCER MSI DN 8 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN UP 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA FOREVER DN 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAMAI APOPTOSIS VIA TRAIL UP 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEREZ TP63 TARGETS 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YORDY RECIPROCAL REGULATION BY ETS1 AND SP100 DN 87 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CEBALLOS TARGETS OF TP53 AND MYC UP 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAFFAREL RESPONSE TO THC DN 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAFFAREL RESPONSE TO THC 8HR 5 DN 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF反应60海拉 46 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI SMALL PRE BII LYMPHOCYTE DN 76 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 1 DN 169 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA CENTRAL CLOCK 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LAMB CCND1 TARGETS 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MENSSEN MYC TARGETS 53 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CLOCK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC DN 63 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT DN 129 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERY CEBP目标 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZAMORA NOS2 TARGETS UP 69 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 2 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C0 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JACKSON DNMT1 TARGETS UP 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE INCIPIENT DN 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WENG POR TARGETS GLOBAL DN 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1 AUTOCRINE TARGETS DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 8HR 39 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制肌肉DN 51 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RESPONSE TO TRABECTEDIN DN 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WENG POR TARGETS LIVER DN 20 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD SRC ONCOGENIC SIGNATURE 62 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER SILENCED BY METHYLATION DN 105 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAY TUMORIGENESIS BY ERBB2 CDC25A DN 159 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MUELLER PLURINET 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG TUMOR INVASIVENESS UP 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS UP 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 8 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KARLSSON TGFB1 TARGETS UP 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG RESPONSE TO GSK3 INHIBITOR SB216763 DN 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP C 92 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GUO TARGETS OF IRS1 AND IRS2 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-320 654 660 1A HSA-MIR-320 AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA
miR-369-3p 120 127 1A,m8 hsa-miR-369-3p AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU