基因页:CPLX2
Summary?
基因ID | 10814 |
象征 | CPLX2 |
同义词 | 921-L | CPX-2 | CPX2 | HFB1 |
描述 | 复合素2 |
参考 | MIM:605033|HGNC:HGNC:2310|Ensembl:ENSG00000145920|HPRD:09234|Vega:Otthumg00000130665 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q35.2 |
Pascal P值 | 0.245 |
Sherlock P值 | 0.944 |
胎儿β | -2.293 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
支持 | 胞吞作用 COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 1 | 链接到Szgene |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.0276 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG08670383 | 5 | 175257943 | CPLX2 | 4.387E-4 | 0.472 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CPLX2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SEC23B | 0.90 | 0.89 |
C5orf15 | 0.88 | 0.87 |
TSN | 0.88 | 0.87 |
USP38 | 0.88 | 0.87 |
Surf4 | 0.88 | 0.84 |
TICAM2 | 0.87 | 0.89 |
TMed7 | 0.87 | 0.89 |
GOLPH3 | 0.87 | 0.87 |
COPB2 | 0.86 | 0.85 |
DCTN4 | 0.86 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.68 | -0.67 |
MT-CO2 | -0.67 | -0.69 |
AF347015.8 | -0.65 | -0.68 |
AF347015.33 | -0.63 | -0.65 |
AF347015.31 | -0.63 | -0.66 |
AC098691.2 | -0.62 | -0.63 |
mt-cyb | -0.62 | -0.65 |
AF347015.27 | -0.61 | -0.65 |
FXYD1 | -0.60 | -0.63 |
AF347015.18 | -0.60 | -0.68 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0019905 | 语法结合 | IEA | 突触(GO期限:5) | - |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0043303 | 肥大细胞脱粒 | IEA | 5-羟色胺(GO期限:9) | - |
去:0006836 | 神经递质运输 | IEA | 神经元,神经递质(GO期限:5) | - |
GO:0006904 | 囊肿囊肿的囊泡对接 | 塔斯 | 7553862 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
tomida转移 | 26 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间 | 110 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制肌肉DN | 51 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LSD1目标DN | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 | 228 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足趋化趋化性 | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病 | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-1/206 | 357 | 364 | 1A,M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua | ||||
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-135 | 1927年 | 1934年 | 1A,M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
HSA-MIR-135B | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga | ||||
HSA-MIR-135B | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga | ||||
HSA-MIR-135B | UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG | ||||
mir-190 | 1931年 | 1937年 | 1a | HSA-MIR-190 | ugauuauguuugauauauauaggu |
mir-326 | 2539 | 2545 | M8 | HSA-MIR-326 | ccucugggcccuccag |
mir-331 | 2265 | 2271 | M8 | HSA-MIR-331脑 | gccccugggccuauccuagaa |
mir-34/449 | 736 | 743 | 1A,M8 | HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu |
HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu | ||||
HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
mir-485-3p | 3910 | 3916 | M8 | hsa-miR-485-3p | gucauacgggcucucucucucucu |