Summary
基因ID 10814
象征 CPLX2
同义词 921-L | CPX-2 | CPX2 | HFB1
描述 复合素2
参考 MIM:605033|HGNC:HGNC:2310|Ensembl:ENSG00000145920|HPRD:09234|Vega:Otthumg00000130665
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q35.2
Pascal P值 0.245
Sherlock P值 0.944
胎儿β -2.293
DMG 1(#研究)
主持人
支持 胞吞作用
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.0276
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08670383 5 175257943 CPLX2 4.387E-4 0.472 0.045 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SEC23B 0.90 0.89
C5orf15 0.88 0.87
TSN 0.88 0.87
USP38 0.88 0.87
Surf4 0.88 0.84
TICAM2 0.87 0.89
TMed7 0.87 0.89
GOLPH3 0.87 0.87
COPB2 0.86 0.85
DCTN4 0.86 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.68 -0.67
MT-CO2 -0.67 -0.69
AF347015.8 -0.65 -0.68
AF347015.33 -0.63 -0.65
AF347015.31 -0.63 -0.66
AC098691.2 -0.62 -0.63
mt-cyb -0.62 -0.65
AF347015.27 -0.61 -0.65
FXYD1 -0.60 -0.63
AF347015.18 -0.60 -0.68

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0019905 语法结合 IEA 突触(GO期限:5) -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0043303 肥大细胞脱粒 IEA 5-羟色胺(GO期限:9) -
去:0006836 神经递质运输 IEA 神经元,神经递质(GO期限:5) -
GO:0006904 囊肿囊肿的囊泡对接 塔斯 7553862
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
tomida转移 26 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除 195 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间 110 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制肌肉DN 51 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LSD1目标DN 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足趋化趋化性 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 357 364 1A,M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-135 1927年 1934年 1A,M8 HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG
HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG
HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG
mir-190 1931年 1937年 1a HSA-MIR-190 ugauuauguuugauauauauaggu
mir-326 2539 2545 M8 HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
mir-331 2265 2271 M8 HSA-MIR-331 gccccugggccuauccuagaa
mir-34/449 736 743 1A,M8 HSA-MIR-34A uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
HSA-MIR-34A uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-485-3p 3910 3916 M8 hsa-miR-485-3p gucauacgggcucucucucucucu