概括
基因 10815
象征 CPLX1
同义词 CPX-I | CPX1
描述 复合素1
参考 MIM:605032|HGNC:HGNC:2309|ENSEMBL:ENSG00000168993|HPRD:09233|Vega:Otthumg00000160005
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P16.3
Pascal P值 0.024
Sherlock P值 0.57
胎儿β -1.377
主持人 小脑半球
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 胞吞作用
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS621071 CHR1 182682810 CPLX1 10815 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
WDR35 0.89 0.92
COPB2 0.89 0.91
AQR 0.89 0.93
C3orf63 0.88 0.91
FNDC3A 0.88 0.90
RAD21 0.88 0.90
SSR1 0.88 0.91
C1orf9 0.88 0.92
zzz3 0.88 0.91
Trip12 0.88 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FXYD1 -0.70 -0.74
MT-CO2 -0.70 -0.78
AF347015.31 -0.68 -0.76
AF347015.21 -0.68 -0.76
AF347015.33 -0.67 -0.74
ifi27 -0.67 -0.73
AF347015.8 -0.66 -0.76
AF347015.27 -0.66 -0.73
myl3 -0.65 -0.71
higd1b -0.65 -0.74

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0019905 语法结合 IEA 突触(GO期限:5) -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007268 突触传输 塔斯 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) 7553862
去:0006836 神经递质运输 IEA 神经元,神经递质(GO期限:5) -
去:0006887 胞吞作用 塔斯 7553862
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
HOOI ST7靶向 94 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向 100 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江口大脑皮层DN 54 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein神经元标记 69 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 114 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李双极性胸腺细胞 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja Islet HNF1A靶向 163 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-135 104 111 1A,M8 HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
HSA-MIR-135A Uauggcuuuuuuuuccuauga
HSA-MIR-135B Uauggcuuuucauuccuaugug
mir-137 625 632 1A,M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-505 989 995 1a HSA-MIR-505 gucaacuugcugguuccuc