基因页:CPLX1
概括?
基因 | 10815 |
象征 | CPLX1 |
同义词 | CPX-I | CPX1 |
描述 | 复合素1 |
参考 | MIM:605032|HGNC:HGNC:2309|ENSEMBL:ENSG00000168993|HPRD:09233|Vega:Otthumg00000160005 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4P16.3 |
Pascal P值 | 0.024 |
Sherlock P值 | 0.57 |
胎儿β | -1.377 |
主持人 | 小脑半球 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 胞吞作用 COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS621071 | CHR1 | 182682810 | CPLX1 | 10815 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CPLX1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
WDR35 | 0.89 | 0.92 |
COPB2 | 0.89 | 0.91 |
AQR | 0.89 | 0.93 |
C3orf63 | 0.88 | 0.91 |
FNDC3A | 0.88 | 0.90 |
RAD21 | 0.88 | 0.90 |
SSR1 | 0.88 | 0.91 |
C1orf9 | 0.88 | 0.92 |
zzz3 | 0.88 | 0.91 |
Trip12 | 0.88 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FXYD1 | -0.70 | -0.74 |
MT-CO2 | -0.70 | -0.78 |
AF347015.31 | -0.68 | -0.76 |
AF347015.21 | -0.68 | -0.76 |
AF347015.33 | -0.67 | -0.74 |
ifi27 | -0.67 | -0.73 |
AF347015.8 | -0.66 | -0.76 |
AF347015.27 | -0.66 | -0.73 |
myl3 | -0.65 | -0.71 |
higd1b | -0.65 | -0.74 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0019905 | 语法结合 | IEA | 突触(GO期限:5) | - |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) | 7553862 |
去:0006836 | 神经递质运输 | IEA | 神经元,神经递质(GO期限:5) | - |
去:0006887 | 胞吞作用 | 塔斯 | 7553862 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
HOOI ST7靶向 | 94 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江口大脑皮层DN | 54 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein神经元标记 | 69 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk精子 | 114 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李双极性胸腺细胞 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja Islet HNF1A靶向 | 163 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-135 | 104 | 111 | 1A,M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga | ||||
HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga | ||||
HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
mir-137 | 625 | 632 | 1A,M8 | HSA-MIR-137 | uauugcuuaagaauacgcguag |
mir-505 | 989 | 995 | 1a | HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc |