概括
基因 10817
象征 FRS3
同义词 frs2-beta | frs2b | frs2beta | snt-2 | snt2
描述 成纤维细胞生长因子受体底物3
参考 MIM:607744|HGNC:HGNC:16970|ENSEMBL:ENSG00000137218|HPRD:06373|Vega:Otthumg0000000014686
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6p21.1
Pascal P值 0.09
Sherlock P值 0.569
胎儿β -0.11
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.033
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.04433

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07967643 6 41747785 FRS3 2.76E-9 -0.012 1.97E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
LSMD1 0.93 0.81
NDUFA2 0.92 0.84
NDUFB7 0.91 0.83
Znhit1 0.90 0.77
C19orf70 0.90 0.78
guk1 0.89 0.74
MRPL54 0.89 0.76
timm8b 0.89 0.72
NDUFA13 0.89 0.83
C7orf59 0.89 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIF16B -0.52 -0.62
FNBP1 -0.50 -0.60
UPF2 -0.50 -0.49
Golgb1 -0.50 -0.55
SOS2 -0.49 -0.54
dync1li2 -0.49 -0.42
AC005035.1 -0.49 -0.59
ZC3H13 -0.49 -0.53
Golga4 -0.49 -0.55
MDN1 -0.48 -0.52

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005158 胰岛素受体结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007165 信号转导 塔斯 8761293
去:0008543 成纤维细胞生长因子受体信号通路 塔斯 8761293
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID SHP2途径 58 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRKR途径 62 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR在疾病中的反应组信号传导 127 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome FRS2介导的级联 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome的下游信号传导激活的FGFR 100 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR的Reactome信号传导 112 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-128 239 245 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-27 239 246 1A,M8 HSA-MIR-27A uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B uucacaguggcuaaguucugc
mir-544 101 107 M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu