基因页：ftcd
概括？
| 基因 | 10841 |
| 象征 | ftcd |
| 同义词 | LCHC1 |
| 描述 | Formimidoyltransferase Cyclodeaminase |
| 参考 | MIM：606806|HGNC：HGNC：3974|ENSEMBL：ENSG00000160282|HPRD：08430|Vega：Otthumg0000000090488 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 21q22.3 |
| Pascal P值 | 0.028 |
| Sherlock P值 | 0.198 |
| 胎儿β | -0.403 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7281816 | 21 | 47578569 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 9.694E-7 | 0.01 | -3088 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS73144711 | 21 | 47579051 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 3.674E-7 | 0.01 | -3570 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS56163044 | 21 | 47579752 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 3.43e-7 | 0.01 | -4271 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS55720515 | 21 | 47579901 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 3.459E-7 | 0.01 | -4420 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7282697 | 21 | 47580415 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 3.454e-7 | 0.01 | -4934 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS55644041 | 21 | 47580532 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 7.075E-7 | 0.01 | -5051 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS56283108 | 21 | 47580575 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 3.962E-7 | 0.01 | -5094 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS56310297 | 21 | 47580600 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 5.268E-7 | 0.01 | -5119 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS75660802 | 21 | 47581074 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 2.494E-7 | 0.01 | -5593 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS113835421 | 21 | 47581693 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 4.155E-7 | 0.01 | -6212 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS58861127 | 21 | 47588735 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 1.487E-7 | 0.01 | -13254 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS8134429 | 21 | 47600157 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 1.603E-7 | 0.01 | -24676 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS79044044 | 21 | 47603849 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 1.906E-6 | 0.01 | -28368 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS73144744 | 21 | 47611285 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 2.696E-7 | 0.01 | -35804 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS9647243 | 21 | 47740415 | ftcd | ENSG00000160282.9 | 3.447E-7 | 0.01 | -164934 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Prkaca | 0.91 | 0.90 |
| ENO2 | 0.91 | 0.92 |
| clstn3 | 0.91 | 0.92 |
| ABCG4 | 0.90 | 0.88 |
| ATP6AP1 | 0.90 | 0.93 |
| SV2A | 0.89 | 0.90 |
| AP2A1 | 0.89 | 0.90 |
| DCTN1 | 0.89 | 0.90 |
| PLBD2 | 0.88 | 0.87 |
| ATP1A3 | 0.88 | 0.88 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.54 | -0.48 |
| GNG11 | -0.50 | -0.51 |
| AP002478.3 | -0.49 | -0.50 |
| AF347015.31 | -0.48 | -0.43 |
| AF347015.2 | -0.48 | -0.37 |
| AF347015.8 | -0.47 | -0.42 |
| AF347015.18 | -0.47 | -0.42 |
| MT-CO2 | -0.47 | -0.43 |
| C1orf54 | -0.46 | -0.48 |
| 鼻孔 | -0.46 | -0.42 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0030409 | 谷氨酸构酰胺转移酶活性 | IEA | 谷氨酸（GO期限：9） | - |
| 去：0005542 | 叶酸结合 | IEA | - | |
| GO：0016829 | 裂解酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| GO：0030412 | 甲甲基二氢叶酸酸酯旋风氨基氨基酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006760 | 叶酸和衍生物代谢过程 | 塔斯 | 10029623 | |
| 去：0006547 | 组氨酸代谢过程 | IEA | - | |
| GO：0044237 | 细胞代谢过程 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 10029623 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg组氨酸代谢 | 29 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg fule一个碳池 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌21q22 Amplicon | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CERVERA SDHB目标1 DN | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hedenfalk乳腺癌BRACX DN | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级转移DN | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌亚类未经注释 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ceribelli启动子不活跃，受NFY的约束 | 44 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |