概括
基因 10847
象征 SRCAP
同义词 domo1 | eaf1 | flhs | swr1
描述 与SNF2相关的CREBBP激活蛋白
参考 MIM:611421|HGNC:HGNC:16974|ENSEMBL:ENSG00000080603|HPRD:18103|Vega:Otthumg00000132393
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p11.2
Pascal P值 0.041
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 染色质重塑基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01775

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
SNP_A-2162733 0 SRCAP 10847 0.14 反式
RS9933246 CHR16 7497701 SRCAP 10847 0.15 反式
RS9935962 CHR16 7504669 SRCAP 10847 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RGS6 0.45 0.43
LRRTM4 0.44 0.44
PDE1A 0.44 0.43
galnt13 0.43 0.36
KCNJ6 0.43 0.38
布拉夫 0.42 0.43
SH3GL2 0.42 0.42
DOK6 0.42 0.40
C6orf142 0.42 0.43
itga11 0.42 0.42
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
VEGFB -0.35 -0.32
Rhoc -0.34 -0.40
EFEMP2 -0.33 -0.28
Rab34 -0.30 -0.32
GATSL3 -0.30 -0.31
C19orf36 -0.29 -0.30
serpinb6 -0.29 -0.33
S100A16 -0.28 -0.34
slc2a4rg -0.28 -0.30
nudt8 -0.28 -0.27

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003677 DNA结合 IEA -
去:0003713 转录共激活因子活性 塔斯 10347196
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004386 解旋酶活性 IEA -
去:0004402 组蛋白乙酰转移酶活性 塔斯 10347196
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006357 调节RNA聚合酶II启动子的转录 塔斯 10347196
去:0006350 转录 IEA -
GO:0016568 染色质修饰 IEA -
GO:0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
早期的粉刺开发 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冷吉非替尼抵抗DN 230 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
jazag tgfb1发出信号 108 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazag TGFB1通过SMAD4向上信号传导 108 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西葫芦转移 43 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时 111 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染2小时 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的611CTF同工型的PEDERSEN目标 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-141/200a 217 224 1A,M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-26 74 81 1A,M8 HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
HSA-MIR-26A Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-324-3p 215 221 M8 HSA-MIR-324-3P ccacugccccaggugcugcugg
mir-491 246 252 M8 HSA-MIR-491 aguggggaacccuuccaugga
mir-9 135 141 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga