基因页：PPP1R13L
概括？
| 基因 | 10848 |
| 象征 | PPP1R13L |
| 同义词 | iaspp | nkip1 | rai | rai4 |
| 描述 | 蛋白质磷酸酶1调节亚基13 |
| 参考 | MIM：607463|HGNC：HGNC：18838|ENSEMBL：ENSG00000104881|HPRD：09195|Vega：Otthumg00000181784 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19q13.32 |
| Pascal P值 | 0.297 |
| 胎儿β | -0.323 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PPP1R13L | CHR19 | 45900128 | C | t | NM_001142502 NM_006663 |
。 。 |
沉默的 沉默的 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 | ||
| PPP1R13L | CHR19 | 45885917 | C | t | NM_001142502 NM_006663 |
。 。 |
沉默的 沉默的 |
精神分裂症 | DNM：Gulsuner_2013 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG07637658 | 19 | 45887042 | PPP1R13L | 1.71E-5 | 0.327 | 0.015 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C3 | 0.81 | 0.80 |
| C1QC | 0.80 | 0.82 |
| adora3 | 0.80 | 0.80 |
| tbxas1 | 0.78 | 0.81 |
| laptm5 | 0.78 | 0.80 |
| SPI1 | 0.78 | 0.78 |
| PTPN6 | 0.77 | 0.74 |
| CSF3R | 0.77 | 0.72 |
| apbb1ip | 0.77 | 0.78 |
| ITGB2 | 0.76 | 0.73 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Scube1 | -0.30 | -0.25 |
| Dact1 | -0.29 | -0.14 |
| mycn | -0.29 | -0.15 |
| Neurod6 | -0.29 | -0.17 |
| SRGAP1 | -0.29 | -0.17 |
| TMC2 | -0.29 | -0.21 |
| FAT4 | -0.29 | -0.15 |
| ZNF124 | -0.29 | -0.20 |
| AC004017.1 | -0.29 | -0.21 |
| vash2 | -0.29 | -0.14 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID P53调节途径 | 59 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王攀登目标DN | 186 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌DN | 77 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马纳洛缺氧 | 207 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 尼尔森脂肪肉瘤DN | 19 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1靶向10小时 | 199 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |