基因页：CYP46A1
概括？
| 基因 | 10858 |
| 象征 | CYP46A1 |
| 同义词 | CP46 | CYP46 |
| 描述 | 细胞色素p450家族46个子菌A成员1 |
| 参考 | MIM：604087|HGNC：HGNC：2641|Ensembl：ENSG00000036530|HPRD：04970|Vega：Otthumg00000171510 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 14Q32.1 |
| Pascal P值 | 0.545 |
| Sherlock P值 | 0.287 |
| 胎儿β | -1.65 |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SP1 | 0.87 | 0.88 |
| CTDSP2 | 0.85 | 0.84 |
| EIF2C1 | 0.84 | 0.86 |
| SS18 | 0.84 | 0.84 |
| EIF2C3 | 0.83 | 0.83 |
| CRTC3 | 0.83 | 0.84 |
| arnt | 0.82 | 0.82 |
| GPATCH8 | 0.82 | 0.83 |
| H6PD | 0.81 | 0.79 |
| NUP98 | 0.81 | 0.80 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.60 | -0.67 |
| AF347015.31 | -0.56 | -0.60 |
| MT-CO2 | -0.56 | -0.60 |
| IL32 | -0.55 | -0.66 |
| ifi27 | -0.55 | -0.58 |
| C1orf54 | -0.54 | -0.64 |
| higd1b | -0.53 | -0.57 |
| CXCL14 | -0.52 | -0.57 |
| AF347015.8 | -0.51 | -0.55 |
| AF347015.27 | -0.50 | -0.56 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005506 | 铁离子结合 | IEA | - | |
| 去：0004497 | 单加氧酶活性 | IEA | - | |
| GO：0020037 | 血红素结合 | IEA | - | |
| 去：0008395 | 类固醇羟化酶活性 | 塔斯 | 10377398 | |
| 去：0009055 | 电子载体活动 | IEA | - | |
| GO：0033781 | 胆固醇24-羟化酶活性 | IEA | - | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突（GO期限：5） | 10377398 |
| 去：0008202 | 类固醇代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0006707 | 胆固醇分解代谢过程 | 塔斯 | 10377398 | |
| 去：0006629 | 脂质代谢过程 | IEA | - | |
| GO：0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005792 | 微型体 | IEA | - | |
| 去：0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
| 去：0005783 | 内质网 | 塔斯 | 10377398 | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG初级胆汁酸生物合成 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胆汁酸和胆汁盐代谢 | 27 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过24羟基胆固醇的胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 | 19 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 底物类型排列的Reactome细胞色素P450 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Phase1化合物的功能化 | 70 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组内源性固醇 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| Let-7/98 | 397 | 403 | M8 | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
| HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
| HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
| HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
| HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
| HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
| HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
| HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
| HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
| mir-505 | 563 | 569 | M8 | HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc |