基因页：HCP5
概括？
| 基因 | 10866 |
| 象征 | HCP5 |
| 同义词 | 6S2650E | D6S2650E | P5-1 |
| 描述 | HLA复合物P5（非蛋白质编码） |
| 参考 | MIM：604676|HGNC：HGNC：21659|Ensembl：ENSG00000206337|HPRD：05245| |
| 基因类型 | ncRNA |
| 地图位置 | 6p21.3 |
| Pascal P值 | 2.697E-9 |
| 胎儿β | -0.026 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG06480496 | 6 | 31430675 | HCP5 | 5.705E-4 | -0.482 | 0.049 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS12087645 | CHR1 | 18509666 | HCP5 | 10866 | 0.08 | 反式 | ||
| RS16852306 | CHR2 | 167417804 | HCP5 | 10866 | 0.06 | 反式 | ||
| RS10505414 | CHR8 | 122940787 | HCP5 | 10866 | 0.01 | 反式 | ||
| RS10990447 | Chr9 | 98412986 | HCP5 | 10866 | 0.19 | 反式 | ||
| RS1955728 | CHR14 | 39976063 | HCP5 | 10866 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| selplg | 0.56 | 0.50 |
| tbxas1 | 0.54 | 0.52 |
| itgam | 0.53 | 0.47 |
| C3AR1 | 0.53 | 0.53 |
| CD74 | 0.53 | 0.46 |
| laptm5 | 0.52 | 0.53 |
| Alox5ap | 0.52 | 0.49 |
| HLA-DRA | 0.51 | 0.44 |
| lilrb1 | 0.51 | 0.45 |
| HLA-DPA1 | 0.50 | 0.47 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GTF3C6 | -0.27 | -0.24 |
| Bcl7c | -0.26 | -0.26 |
| SH3BP2 | -0.25 | -0.24 |
| plekho1 | -0.25 | -0.19 |
| TTLL2 | -0.25 | -0.18 |
| RBMX2 | -0.24 | -0.25 |
| exosc8 | -0.24 | -0.23 |
| CCDC28B | -0.24 | -0.27 |
| RP9P | -0.24 | -0.36 |
| AS3MT | -0.24 | -0.20 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bertucci髓质与导管乳腺癌 | 206 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graham CML划分与正常静止DN | 95 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 唱机转移基质DN | 54 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标1向上 | 140 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤 | 64 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞DN | 216 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee早期T淋巴细胞DN | 57 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng通过ERCC6 DN对H2O2的响应 | 46 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巨噬细胞的库马尔病原体负荷 | 275 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kumar自噬网络 | 71 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |