基因页：FGL2

概括?
基因ID 10875
Symbol FGL2
同义词 T49 | PT49
描述 fibrinogen like 2
参考 MIM：605351|HGNC：HGNC：3696|ENSEMBL：ENSG00000127951|HPRD：16098|Vega:OTTHUMG00000130681
基因type protein-coding
地图位置 7q11.23
Pascal P值 0.015
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
GO_Annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations Hits with neuro-related keywords: 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs17131472 chr1 91962966 FGL2 10875 1.493E-5 trans
RS546975 chr1 91963738 FGL2 10875 0.04 trans
snp_a-2062139 0 FGL2 10875 0.14 trans
rs10218671 chr1 158362552 FGL2 10875 0.15 trans
RS17021120 chr2 37843018 FGL2 10875 0.09 trans
RS17021123 chr2 37843420 FGL2 10875 0.09 trans
RS17021127 chr2 37843523 FGL2 10875 0.06 trans
rs17821815 chr2 119018522 FGL2 10875 0.13 trans
rs2115055 chr2 119478688 FGL2 10875 0.05 trans
rs2922180 chr3 125280472 FGL2 10875 1.152E-5 trans
RS2971271 chr3 125450402 FGL2 10875 0.01 trans
rs2976809 chr3 125451738 FGL2 10875 3.821E-8 trans
RS9917710 chr3 176280218 FGL2 10875 0.2 trans
RS6437445 chr3 194694054 FGL2 10875 0.13 trans
rs16889842 chr4 9872012 FGL2 10875 0.01 trans
SNP_A-1976228 0 FGL2 10875 0.04 trans
RS17090446 chr4 62255221 FGL2 10875 0.04 trans
RS7668550 chr4 104384355 FGL2 10875 0.07 trans
rs3796892 chr4 111404774 FGL2 10875 0.01 trans
rs4033102 chr4 111784204 FGL2 10875 0.01 trans
RS509952 chr4 111788169 FGL2 10875 0.01 trans
RS313946 chr4 113975904 FGL2 10875 0 trans
RS657141 chr4 113981041 FGL2 10875 0.13 trans
rs10065849 chr5 30592364 FGL2 10875 0.13 trans
rs10050805 chr5 30805352 FGL2 10875 5.68e-5 trans
rs837115 chr5 40736290 FGL2 10875 0.05 trans
RS6449550 chr5 61034312 FGL2 10875 0.04 trans
rs6874540 chr5 149911669 FGL2 10875 0.02 trans
rs2273232 chr5 149912526 FGL2 10875 0.02 trans
RS17056435 chr5 158453782 FGL2 10875 1.814E-5 trans
RS9313797 chr5 158465457 FGL2 10875 0.15 trans
RS17056474 chr5 158468105 FGL2 10875 0.15 trans
rs17135501 chr6 2704474 FGL2 10875 0 trans
rs17135521 chr6 2707631 FGL2 10875 0 trans
SNP_A-1787926 0 FGL2 10875 0 trans
rs6455226 chr6 67930295 FGL2 10875 0.01 trans
RS2064428 chr6 85067126 FGL2 10875 0.03 trans
RS9451867 chr6 92659609 FGL2 10875 0.06 trans
rs283058 chr6 118625224 FGL2 10875 0.17 trans
RS8192621 chr6 132966206 FGL2 10875 0.2 trans
RS2056744 chr6 144952933 FGL2 10875 0.03 trans
rs17073995 chr6 144958809 FGL2 10875 0.12 trans
rs2398707 chr7 2113428 FGL2 10875 0.18 trans
RS3778951 chr7 2125319 FGL2 10875 0.18 trans
RS3778957 chr7 2127710 FGL2 10875 0.18 trans
rs2286089 chr7 38789903 FGL2 10875 0.12 trans
rs10085487 chr7 38870379 FGL2 10875 0.13 trans
RS17165913 chr7 93555935 FGL2 10875 0.17 trans
rs2430483 chr7 104548631 FGL2 10875 0.02 trans
rs2515591 chr8 6335547 FGL2 10875 0.1 trans
rs2515434 chr8 6374892 FGL2 10875 0.15 trans
rs2442623 chr8 6376337 FGL2 10875 0.15 trans
rs2515437 chr8 6377140 FGL2 10875 0.15 trans
RS1960369 chr8 6379235 FGL2 10875 0.08 trans
rs2199402 chr8 9201002 FGL2 10875 0.06 trans
rs7841407 chr8 9243427 FGL2 10875 0.02 trans
RS2739726 chr8 17998576 FGL2 10875 0.03 trans
RS3808368 chr8 32503075 FGL2 10875 0.09 trans
rs2954041 chr8 32522625 FGL2 10875 0.01 trans
RS2919377 chr8 32573740 FGL2 10875 0.02 trans
RS2976526 chr8 32574650 FGL2 10875 0.01 trans
RS2975504 chr8 32578998 FGL2 10875 0.01 trans
RS16929407 chr8 63602017 FGL2 10875 0.12 trans
RS16929409 chr8 63603088 FGL2 10875 0.09 trans
RS16929424 chr8 63608389 FGL2 10875 0.06 trans
RS16908622 chr8 139231604 FGL2 10875 0.13 trans
rs7850851 chr9 37928770 FGL2 10875 0.02 trans
rs10521469 chr9 78884328 FGL2 10875 0.18 trans
RS2253777 chr9 93467893 FGL2 10875 0.04 trans
RS427497 chr9 107982791 FGL2 10875 0.14 trans
rs6478086 chr9 117273020 FGL2 10875 0.17 trans
rs998410 chr9 117622673 FGL2 10875 0 trans
rs9423711 chr10 2574802 FGL2 10875 0 trans
RS748375 chr10 33440178 FGL2 10875 0.04 trans
rs4514358 chr10 43861923 FGL2 10875 4.149E-4 trans
rs7081666 chr10 47673800 FGL2 10875 0.01 trans
rs2116478 chr11 83362424 FGL2 10875 0.05 trans
rs2305164 chr12 365649 FGL2 10875 0 trans
rs2098090 chr12 4770747 FGL2 10875 0.03 trans
rs10747972 0 FGL2 10875 0.12 trans
RS995817 chr12 67557935 FGL2 10875 0.01 trans
rs10879027 chr12 70237156 FGL2 10875 6.184E-4 trans
rs11179317 chr12 73069562 FGL2 10875 0.07 trans
RS11112163 chr12 105072508 FGL2 10875 0.01 trans
RS11067174 chr12 115011927 FGL2 10875 0.02 trans
RS17080889 chr13 20939135 FGL2 10875 0.03 trans
RS9552848 chr13 23705933 FGL2 10875 0.13 trans
RS9551590 chr13 29589464 FGL2 10875 0.01 trans
rs1750009 chr13 42657093 FGL2 10875 0.05 trans
rs7982922 chr13 43873335 FGL2 10875 0.19 trans
RS9596788 chr13 53924430 FGL2 10875 0.11 trans
RS9529974 chr13 72821935 FGL2 10875 0.01 trans
rs17073665 chr13 81541961 FGL2 10875 0 trans
RS11840833 chr13 94378306 FGL2 10875 1.552E-4 trans
rs9302031 chr13 95633204 FGL2 10875 0.16 trans
RS17381373 chr13 109002943 FGL2 10875 0.13 trans
RS16975617 chr13 110867407 FGL2 10875 0.17 trans
rs10142086 chr14 35135892 FGL2 10875 0.07 trans
rs1956517 chr14 37738426 FGL2 10875 0.01 trans
rs10498433 chr14 52289530 FGL2 10875 0.11 trans
RS1951867 chr14 54407191 FGL2 10875 0.1 trans
rs2093759 chr14 97171024 FGL2 10875 0 trans
RS17244419 chr14 97171074 FGL2 10875 1.708E-4 trans
rs7177212 chr15 34425413 FGL2 10875 0.09 trans
rs16976022 chr15 55454260 FGL2 10875 0.08 trans
rs16976029 chr15 55455268 FGL2 10875 0.06 trans
rs16976036 chr15 55456921 FGL2 10875 0.16 trans
rs7165622 chr15 93979910 FGL2 10875 0.05 trans
rs13380712 chr16 25601181 FGL2 10875 0.01 trans
rs17841422 chr17 20969134 FGL2 10875 0.01 trans
RS8079075 chr17 38010814 FGL2 10875 0.06 trans
RS16977927 chr17 72154232 FGL2 10875 0.06 trans
RS16940550 chr18 13442256 FGL2 10875 0.05 trans
RS7236407 chr18 47827597 FGL2 10875 0.03 trans
rs11873703 chr18 61448702 FGL2 10875 1.213E-6 trans
rs6017989 chr20 45329846 FGL2 10875 0.11 trans
rs6095741 chr20 48666589 FGL2 10875 2.455E-9 trans
RS6004906 chr22 26434554 FGL2 10875 0.08 trans
RS6000401 chr22 37149335 FGL2 10875 0.05 trans
rs5768165 chr22 48318197 FGL2 10875 0.2 trans
rs5768168 chr22 48319334 FGL2 10875 0.2 trans
RS5768173 chr22 48321475 FGL2 10875 0.2 trans
rs1883665 chrX 17650382 FGL2 10875 0.1 trans
rs5991662 chrX 43335796 FGL2 10875 0 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
rundc3a 0.92 0.92
FKBP8 0.90 0.90
ST6GALNAC6 0.89 0.90
ptges2 0.89 0.90
哈格 0.89 0.91
NBL1 0.87 0.89
TUBG2 0.87 0.88
GNG3 0.86 0.88
HMOX2 0.86 0.87
SH3GLB2 0.86 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
THOC2 -0.57 -0.52
ZNF300 -0.57 -0.31
atad2b -0.56 -0.47
BAZ1A -0.56 -0.76
IGF2BP2 -0.56 -0.53
EZH2 -0.56 -0.50
IGF2BP3 -0.55 -0.43
ZNF345 -0.55 -0.43
UPF3B -0.55 -0.53
nasp -0.55 -0.45

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005102 受体结合 IEA Neurotransmitter (GO term level: 4) -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0007165 signal transduction IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005576 extracellular region IEA -
GO:0005577 fibrinogen complex 塔斯 7642106

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
SCHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE UP 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piepoli LGI1靶向 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA DN 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vmyb vs cmyb的刘目标 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAL LEUKEMIC STEM CELL DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
维克曼石棉肺癌DN 28 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16D的Takeda目标 175 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILBAN B CLL LPL DN 42 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION MONOCYTE DN 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斋丁嫩造血干细胞DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mahadevan伊马替尼抵抗DN 20 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BORLAK LIVER CANCER EGF UP 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
瓦特自动甲状腺腺瘤DN 55 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2 TARGETS DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与B淋巴细胞向上 78 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HBV感染的Wieland 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU IL4 SIGNALING 94 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL WITH VH REARRANGEMENTS UP 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LENAOUR DENDRITIC CELL MATURATION DN 128 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS LATE PROGENITOR 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 2 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Burton脂肪形成峰在8小时 39 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAVIN PDE3B TARGETS 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE UP 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU SILENCED BY METHYLATION IN BLADDER CANCER 55 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病D7 UP 107 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病35D UP 131 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION D 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN SMALL PRE BII TO IMMATURE B LYMPHOCYTE DN 50 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN VARIABLE EARLY DIFFERENTIATION GENES UP 15 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER LATE RECURRENCE UP 62 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 74 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN IPS ICP WITH H3K4ME3 AND H327ME3 126 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA1 UP 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANDRAN METASTASIS DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN ES ICP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 137 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NIELSEN GIST VS SYNOVIAL SARCOMA DN 20 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向DN 148 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG BCL3 TARGETS UP 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDRIOLI MIR31 TARGETS DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RATTENBACHER BOUND BY CELF1 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALTEMEIER RESPONSE TO LPS WITH MECHANICAL VENTILATION 128 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM GLYCOPROTEINS 196 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-124.1 2373 2380 1A,m8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA