概括
基因 10876
象征 EDDM3A
同义词 ep3a | fam12a | he3-alpha | he3a | he3alpha | ram1
描述 附子蛋白3a
参考 MIM:611580|HGNC:HGNC:16978|ENSEMBL:ENSG00000181562|HPRD:13289|Vega:Otthumg0000000029581
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q11.2
Pascal P值 0.394
胎儿β -0.16

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ACTR10 0.86 0.87
C10orf97 0.85 0.86
vapa 0.84 0.87
MRPS35 0.84 0.84
ORC4L 0.84 0.84
RAP1GDS1 0.83 0.87
MORF4L1 0.82 0.84
CCNC 0.82 0.82
ATG5 0.82 0.83
polr3f 0.82 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.2 -0.58 -0.53
AF347015.8 -0.56 -0.50
AF347015.26 -0.55 -0.50
GPT -0.55 -0.56
MT-CO2 -0.55 -0.49
mt-cyb -0.54 -0.49
AF347015.15 -0.54 -0.49
AF347015.18 -0.54 -0.53
AF347015.33 -0.53 -0.49
EIF4EBP3 -0.53 -0.58

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003676 核酸结合 IEA -
去:0004522 胰腺核糖核酸酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007321 精子位移 塔斯 7514008
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005615 细胞外空间 塔斯 7514008

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因