基因页:EDDM3A
概括?
基因 | 10876 |
象征 | EDDM3A |
同义词 | ep3a | fam12a | he3-alpha | he3a | he3alpha | ram1 |
描述 | 附子蛋白3a |
参考 | MIM:611580|HGNC:HGNC:16978|ENSEMBL:ENSG00000181562|HPRD:13289|Vega:Otthumg0000000029581 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q11.2 |
Pascal P值 | 0.394 |
胎儿β | -0.16 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EDDM3A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ACTR10 | 0.86 | 0.87 |
C10orf97 | 0.85 | 0.86 |
vapa | 0.84 | 0.87 |
MRPS35 | 0.84 | 0.84 |
ORC4L | 0.84 | 0.84 |
RAP1GDS1 | 0.83 | 0.87 |
MORF4L1 | 0.82 | 0.84 |
CCNC | 0.82 | 0.82 |
ATG5 | 0.82 | 0.83 |
polr3f | 0.82 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.2 | -0.58 | -0.53 |
AF347015.8 | -0.56 | -0.50 |
AF347015.26 | -0.55 | -0.50 |
GPT | -0.55 | -0.56 |
MT-CO2 | -0.55 | -0.49 |
mt-cyb | -0.54 | -0.49 |
AF347015.15 | -0.54 | -0.49 |
AF347015.18 | -0.54 | -0.53 |
AF347015.33 | -0.53 | -0.49 |
EIF4EBP3 | -0.53 | -0.58 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003676 | 核酸结合 | IEA | - | |
去:0004522 | 胰腺核糖核酸酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007321 | 精子位移 | 塔斯 | 7514008 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | 塔斯 | 7514008 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |