基因页：SUGT1
概括？
| 基因 | 10910 |
| 象征 | SUGT1 |
| 同义词 | SGT1 |
| 描述 | SGT1同源物，MIS12 KineTochore复合物组件割手酮 |
| 参考 | MIM：604098|HGNC：HGNC：16987| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 13Q14.3 |
| Pascal P值 | 0.003 |
| Sherlock P值 | 0.977 |
| 胎儿β | 0.214 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG26168557 | 13 | 53226688 | SUGT1 | 1.52e-12 | -0.014 | 1.43E-7 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10507575 | CHR13 | 53791403 | SUGT1 | 10910 | 0.13 | 顺式 | ||
| RS8002469 | CHR13 | 53936312 | SUGT1 | 10910 | 0.16 | 顺式 | ||
| RS1155107 | CHR3 | 26843376 | SUGT1 | 10910 | 0.08 | 反式 | ||
| RS17029291 | CHR3 | 32402138 | SUGT1 | 10910 | 0.02 | 反式 | ||
| RS17165234 | CHR5 | 126403634 | SUGT1 | 10910 | 0.03 | 反式 | ||
| RS3779536 | CHR7 | 127233976 | SUGT1 | 10910 | 0.09 | 反式 | ||
| RS7894597 | Chr10 | 9384581 | SUGT1 | 10910 | 0.06 | 反式 | ||
| RS7895623 | Chr10 | 57180539 | SUGT1 | 10910 | 0.19 | 反式 | ||
| RS7076439 | Chr10 | 93286841 | SUGT1 | 10910 | 0.12 | 反式 | ||
| RS11226214 | Chr11 | 104046824 | SUGT1 | 10910 | 0.15 | 反式 | ||
| RS1324669 | CHR13 | 107872446 | SUGT1 | 10910 | 8.182E-7 | 反式 | ||
| RS12441507 | CHR15 | 61484028 | SUGT1 | 10910 | 0.07 | 反式 | ||
| RS17145698 | Chrx | 40218345 | SUGT1 | 10910 | 1.118E-5 | 反式 | ||
| RS17328938 | Chrx | 99519447 | SUGT1 | 10910 | 0.09 | 反式 | ||
| RS1335267 | Chrx | 99570223 | SUGT1 | 10910 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC25A11 | 0.82 | 0.76 |
| MRPL4 | 0.82 | 0.77 |
| C11orf59 | 0.82 | 0.80 |
| MRPL38 | 0.81 | 0.79 |
| WDR45 | 0.81 | 0.81 |
| TMEM222 | 0.80 | 0.81 |
| NIT1 | 0.80 | 0.77 |
| yipf2 | 0.80 | 0.75 |
| HDHD3 | 0.80 | 0.77 |
| ACY1 | 0.79 | 0.76 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SEC62 | -0.48 | -0.54 |
| EIF5B | -0.47 | -0.52 |
| AC010300.1 | -0.42 | -0.56 |
| AF347015.18 | -0.41 | -0.43 |
| MT-ATP8 | -0.39 | -0.38 |
| NSBP1 | -0.38 | -0.43 |
| AC005921.3 | -0.37 | -0.47 |
| AC016705.1 | -0.36 | -0.34 |
| AC073534.1 | -0.34 | -0.48 |
| AC100783.1 | -0.33 | -0.30 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg点头喜欢受体信号通路 | 62 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rashi对电离辐射6的响应6 | 84 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇9的时间反应9 | 76 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |