SZGR2 - Beplay体育中心

Summary？

基因	10921
象征	RNPS1
同义词	E5.1
描述	RNA结合蛋白S1，富含丝氨酸的结构域
参考	MIM：606447\|HGNC：HGNC：10080\|Ensembl：ENSG00000205937\|HPRD：07341\|Vega：Otthumg00000128828
基因类型	蛋白质编码
地图位置	16p13.3
Pascal P值	0.181
Sherlock P值	0.593
胎儿β	0.252
DMG	1（＃研究）
主持人	小脑半球小脑迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG：Nishioka_2013	全基因组DNA甲基化分析	作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。	1

第一节遗传学和表观遗传学注释

差异甲基化基因

探测	染色体	位置	最近的基因	p（dis）	beta（dis）	fdr（dis）	学习
CG06728335	16	2318300	RNPS1		-0.021	0.79	DMG：Nishioka_2013

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	PVALUE	QVALUE	TSS距离	EQTL类型
RS17795337	CHR6	136492658	RNPS1	10921		0.19		反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
TMEM85	0.83	0.78
POP4	0.82	0.77
PDCD6	0.82	0.78
prkag1	0.82	0.77
SNX11	0.81	0.78
DRG2	0.81	0.77
NIT1	0.81	0.77
Stoml2	0.81	0.77
WDR61	0.80	0.73
MRPS7	0.80	0.75

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
AF347015.18	-0.60	-0.44
AC010300.1	-0.59	-0.62
AC100783.1	-0.52	-0.39
AF347015.26	-0.49	-0.32
C10orf108	-0.48	-0.40
AC016705.1	-0.48	-0.41
AC073957.1	-0.47	-0.41
AF347015.2	-0.47	-0.27
AF347015.8	-0.44	-0.27
MT-ATP8	-0.44	-0.29

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	别名b	官方全名b	实验	资源	PubMed ID
AP2B1	ADTB2 \|AP105B \|ap2-beta \|clapb1 \|DKFZP781K0743	与Adaptor相关的蛋白质复合物2，β1亚基	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
ARS2	ASR2 \|MGC126427	砷酸盐抗性蛋白2	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
C14orf102	FLJ10008 \| FLJ14051	染色体14开放阅读框102	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
C19orf29	NY-REN-24 \|仙人掌\|FSAPC	染色体19开放阅读框29	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
C20ORF11	TWA1	染色体20开放阅读框11	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
cdc2l1	cdc2l2 \|CDK11 \|CDK11-P110 \|CDK11-P46 \|CDK11-P58 \|CLK-1 \|FLJ59152 \|PK58 \|P58 \|P58CDC2L1 \| p58CLK-1	细胞分裂周期2样1（pitslre蛋白）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
cdc2l2	cdc2l3 \|CDK11-P110 \|CDK11-P46 \|CDK11-P58 \|MGC131975 \|pitslre \|P58GTA	细胞分裂周期2样2（Pitslre蛋白）	-	HPRD，Biogrid	9580558
CPSF2	CPSF100 \|KIAA1367	裂解和聚腺苷酸化因子2，100KDA	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
CPSF6	CFIM \|CFIM68 \|HPBRII-4 \|HPBRII-7	裂解和聚腺苷酸化因子6，68KDA	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
庄稼	luc7a \|OA48-18	顺铂抗性相关的过表达蛋白	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
CSNK2A1	CK2A1 \|CKII	酪蛋白激酶2，α1多肽	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
CSNK2A2	CK2A2 \|CSNK2A1 \|FLJ43934	酪蛋白激酶2，α素多肽	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
CSNK2B	CK2B \|CK2N \|CSK2B \|g5a \|MGC138222 \|MGC138224	酪蛋白激酶2，β多肽	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
DDX20	DKFZP434H052 \|DP103 \|双子座3	死亡（ASP-GLU-ALA-ASP）盒多肽20	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
DDX23	MGC8416 \|PRPF28 \|U5-100K \|U5-100KD \|PRP28	死亡（ASP-GLU-ALA-ASP）盒多肽23	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
DDX41	ABS \|MGC8828	死亡（ASP-GLU-ALA-ASP）盒多肽41	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
DHX38	DDX38 \|KIAA0224 \|prp16 \|PRPF16	DEAH（ASP-GLU-ALA-HIS）盒多肽38	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
DVL2	-	Dish，DSH同源2（果蝇）	两个杂交	Biogrid	16189514
eftud2	DKFZP686E24196 \|FLJ44695 \|KIAA0031 \|SNRP116 \|SNU114 \|U5-116KD	伸长因子TU GTP结合结构域包含2	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
fip1l1	DKFZP586K0717 \|FLJ33619 \|Rhe	fip1像1（S. cerevisiae）	RNPS1与DKFZP586K0717相互作用。	绑定	14729963
双子座4	DKFZP434B131 \|DKFZP434D174 \|HC56 \|HCAP1 \|HHRF-1 \|P97	宝石（核管细胞器）相关蛋白4	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
KHK	-	Ketohexokinase（果糖酶）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
Luc7l	FLJ10231 \|类似Luc7 \|luc7b1 \|SR+89	类似Luc7（S. cerevisiae）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
luc7l2	CGI-59 \|CGI-74 \|FLJ10657 \|luc7b2	Luc7样2（S. cerevisiae）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
mkln1	FLJ11162 \|twa2	麝香素1，含有kelch图案的细胞内介体	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
nktr	DKFZP686F1754 \|DKFZP686G0426 \|DKFZP686J06106 \|DKFZP686N24126 \|MGC90527 \|P104	自然杀手肿瘤识别顺序	RNPS1与NKTR相互作用。	绑定	14729963
nudt21	CFIM25 \|CPSF5 \|DKFZP686H1588	nudix（核苷二磷酸链接部分X）-Type基序21	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
PNN	Drs \|SDK3 \|mema \|pinin	pinin, desmosome associated protein	-	HPRD，Biogrid	14517304
PRPF3	hprp3 \|HPRP3P \|prp3 \|PRP3P \|RP18	PRP3前MRNA处理因子3同源物（S. cerevisiae）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
PRPF40A	FBP-11 \|FBP11 \|flaf1 \|FLJ20585 \|fnbp3 \|hip10 \|hypa \|NY-REN-6	PRP40前MRNA处理因子40同源物A（酿酒酵母）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
PRPF4B	KIAA0536 \|pr4h \|prp4 \|prp4h \|prp4k \|DJ1013A10.1	PRP4前MRNA处理因子4同源物B（酵母）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
PRPF6	ant-1 \|C20orf14 \|汤姆\|U5-102K \|HPRP6	PRP6前MRNA处理因子6同源物（S. cerevisiae）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
PRPF8	HPRP8 \|prp8 \|PRPC8 \|RP13	PRP8前MRNA处理因子8同源物（S. cerevisiae）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
PSME3	ki \|PA28-GAMMA \|PA28G \|Reg-Gamma	蛋白酶体（Prosome，大型）激活剂亚基3（PA28伽马; ki）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
PUF60	fir \|FLJ31379 \|robpi \|siahbp1	poly-U结合剪接因子60kDa	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
RANBP9	ranbpm	运行结合蛋白9	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
抢	Argrs \|dalrd1 \|MGC8641	精氨酸-TRNA合成酶	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
RBM25	MGC105088 \|MGC117168 \|Red120 \|RNPC7 \|S164 \|FSAP94	RNA结合基序蛋白25	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
RBM8A	bov-1a \|bov-1b \|bov-1c \|MDS014 \|RBM8 \|RBM8B \|Y14 \|Znrp \|ZRNP1	RNA结合基序蛋白8a	重构的复合物	Biogrid	11707413
sart3	DSAP1 \|KIAA0156 \|MGC138188 \|P100 \|RP11-13G14 \|TIP110 \|P110 \|P110（NRB）	T细胞识别的鳞状细胞癌抗原3	-	HPRD，Biogrid	11477570
SF3B1	prp10 \|PRPF10 \|SAP155 \|SF3B155	剪接因子3B，亚基1，155KDA	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SF3B3	KIAA0017 \| RSE1 \| SAP130 \| SF3b130 \| STAF130	剪接因子3B，亚基3，130kDa	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SFRS1	ASF \|MGC5228 \|SF2 \|sf2p33 \|SRP30A	剪接因子，精氨酸/丝氨酸富含1	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SFRS10	DKFZP686F18120 \|htra2-beta \|SRFS10 \|tra2-beta \|tra2b \|tran2b	剪接因子，精氨酸/丝氨酸富10（变压器2同源物，果蝇）	RNPS1与Htra2-beta相互作用。	绑定	14729963
SFRS10	DKFZP686F18120 \|htra2-beta \|SRFS10 \|tra2-beta \|tra2b \|tran2b	剪接因子，精氨酸/丝氨酸富10（变压器2同源物，果蝇）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SFRS11	DKFZP686M13204 \|DJ677H15.2 \|p54	剪接因子，精氨酸/丝氨酸富含11	RNPS1与p54相互作用。	绑定	14729963
SFRS12	DKFZP564B176 \|MGC133045 \|SRRP508 \|SRRP86	剪接因子，精氨酸/丝氨酸富集12	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SFRS2	PR264 \|SC-35 \|SC35 \|SFRS2A \|SRP30B	剪接因子，精氨酸/丝氨酸2	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SFRS6	B52 \|FLJ08061 \|MGC5045 \|SRP55	剪接因子，精氨酸/丝氨酸6	两个杂交	Biogrid	16189514
SFRS7	9G8 \|AAG3	剪接因子，精氨酸/丝氨酸富7、35KDA	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SFRS8	MGC167082 \|交换	剪接因子，精氨酸/丝氨酸富8（抑制白色 - 阿普罗特同源物，果蝇）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SIP1	gemin2 \|sip1-delta	运动神经元蛋白相互作用蛋白1的存活率1	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SKIV2L2	DOB1 \|KIAA0052 \|MGC142069 \|mtr4 \|FSAP118	超级杀伤剂病毒活性2类样2（酿酒酵母）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SNRNP200	ASCC3L1 \|brr2 \|Helic2 \|U5-200KD	小核核糖核蛋白200KDA（U5）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SNRNP70	rnpu1z \|RPU1 \|SNRP70 \|U170K \|U1AP \|U1RNP	小核核糖核蛋白70KDA（U1）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SNRPA	U1a	小核核糖核蛋白多肽A	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SRPK1	SFRSK1	SFRS蛋白激酶1	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SRPK2	FLJ36101 \|SFRSK2	SFRS蛋白激酶2	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SRM1	160-kd \|MGC39488 \|pop101 \|SRM160	丝氨酸/精氨酸重复矩阵1	-	HPRD，Biogrid	12093754
SRM2	300-kd \|CWF21 \|DKFZP686O15166 \|FLJ21926 \|FLJ22250 \|KIAA0324 \|MGC40295 \|SRL300 \|SRM300	丝氨酸/精氨酸重复矩阵2	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
带子	mawd \|pt-wd \|展开	丝氨酸/苏氨酸激酶受体相关蛋白	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
TAF2	CIF150 \|taf2b \|TAFII150	TAF2 RNA聚合酶II，TATA盒结合蛋白（TBP）相关因子，150KDA	RNPS1与CIF150相互作用。	绑定	14729963
thrap3	FLJ22082 \|MGC133082 \|MGC133083 \|陷阱150	甲状腺激素受体相关蛋白3	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
U2AF2	U2AF65	U2小核RNA辅助因子2	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
USP7	hausp \|tef1	泛素特异性肽酶7（疱疹病毒相关）	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
WDR33	FLJ11294 \|WDC146	WD重复域33	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
ZFR	FLJ41312 \|ZFR1	锌指RNA结合蛋白	RNPS1与ZFR相互作用。	绑定	14729963

V.途径注释

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理	140	77	该途径中的所有SZGR 2.0基因
成熟转录本向细胞质的反应组传输	54	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RNA Pol II转录	105	54	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA处理	161	86	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA剪接	111	58	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录	210	127	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA 3末端处理	35	18	该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢	284	128	该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢	330	155	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组在终止区域增长的转录本的裂解	44	22	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强	176	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧	92	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN	335	193	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN	180	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dittmer Pthlh靶向	112	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN	1375	806	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN	508	354	该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment	536	340	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射2的响应2	127	92	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络	1652	1023	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标	775	494	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因	648	385	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN	457	302	该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn	668	419	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SYED雌二醇反应	19	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常老化DN	225	124	该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束	1103	714	该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心	335	193	该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m	216	124	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up	756	494	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病持续时间corr dn	146	90	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN	1972年	1213	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN	882	538	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：RNPS1

第一节遗传学和表观遗传学注释

差异甲基化基因

EQTL注释

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

时间变化的基因表达（brainspan）

大脑区域的顶级共表达基因

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

V.途径注释