基因页:Fastk
概括?
基因 | 10922 |
象征 | Fastk |
同义词 | 快速地 |
描述 | Fas激活丝氨酸/苏氨酸激酶 |
参考 | MIM:606965|HGNC:HGNC:24676|Ensembl:ENSG00000164896|HPRD:07368|Vega:Otthumg00000158694 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q35 |
Pascal P值 | 5.973E-4 |
Sherlock P值 | 0.12 |
胎儿β | -0.547 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG26975609 | 7 | 150777587 | Fastk | -0.037 | 0.85 | DMG:Nishioka_2013 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS62502607 | 7 | 149851574 | Fastk | ENSG00000164896.15 | 2.24479E-6 | 0.05 | 926375 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FASTK_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HSPH1 | 0.86 | 0.80 |
DNAJA4 | 0.78 | 0.80 |
PPP4R4 | 0.78 | 0.75 |
blzf1 | 0.77 | 0.80 |
KIAA1279 | 0.77 | 0.78 |
TPMT | 0.77 | 0.87 |
IDH3A | 0.76 | 0.88 |
KRT222P | 0.76 | 0.83 |
setd3 | 0.76 | 0.84 |
arl1 | 0.75 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
透明2 | -0.46 | -0.53 |
Bcl7c | -0.45 | -0.62 |
SLC38A5 | -0.45 | -0.52 |
RAMP2 | -0.45 | -0.55 |
sigirr | -0.44 | -0.56 |
SLC16A13 | -0.44 | -0.51 |
SH3BP2 | -0.44 | -0.53 |
NME4 | -0.43 | -0.60 |
SH2D2A | -0.42 | -0.52 |
mylk2 | -0.42 | -0.44 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射5的响应5 | 147 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛克伍德在肺癌中放大 | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiba对TSA的反应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HU基因毒素作用直接与间接24小时 | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HNE和TBH的Weigel氧化应激 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee转移和替代剪接 | 74 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ivanovska mir106b目标 | 90 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |