Gene Page:DBF4

概括?
GeneID 10926
Symbol DBF4
同义词 问| chif | dbf4a | zdbf1
描述 DBF4锌指
参考 MIM:604281|HGNC：HGNC：17364|Ensembl:ENSG00000006634|HPRD:10371|Vega：Otthumg00000131034
Gene type protein-coding
地图位置 7q21.3
Pascal P值 0.008
Sherlock P值 0.088

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.0214

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0003676 nucleic acid binding IEA -
GO:0005515 protein binding 新闻学会 15231747
GO:0008270 zinc ion binding IEA -
去：0008047 酶激活剂活性 塔斯 10373557
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000082 G1/S transition of mitotic cell cycle 塔斯 10373557
GO:0006260 DNA replication EXP 12791985
GO:0006260 DNA replication 塔斯 10373557
去：0007049 细胞周期 IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005622 intracellular IEA -
GO:0005634 核 IEA -
GO:0005654 nucleoplasm EXP 10846177|15226314|15707391

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
CDC7 CDC7L1 | HsCDC7 | Hsk1 | MGC117361 | MGC126237 | MGC126238 | huCDC7 cell division cycle 7 homolog (S. cerevisiae) - HPRD 10373557 | 10523313|12614612
CDC7 CDC7L1 | HsCDC7 | Hsk1 | MGC117361 | MGC126237 | MGC126238 | huCDC7 cell division cycle 7 homolog (S. cerevisiae) HSCDC7与HSDBF4相互作用。 BIND 10523313
CDC7 CDC7L1 | HsCDC7 | Hsk1 | MGC117361 | MGC126237 | MGC126238 | huCDC7 cell division cycle 7 homolog (S. cerevisiae) Affinity Capture-Western
in vivo
Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 10373557|10523313
|12614612
CHEK2 CDS1 | CHK2 | HuCds1 | LFS2 | PP1425 | RAD53 CHK2 checkpoint homolog (S. pombe) - HPRD，Biogrid 12441400
LSM8 YJR022W LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) 两个杂交 BioGRID 15231747
MCM2 BM28 |ccnl1 |CDCL1 |D3S3194 |KIAA0030 |MGC10606 |米托蛋白|CDC19 minichromosome maintenance complex component 2 - HPRD，Biogrid 12614612
MCM3 HCC5 | MGC1157 | P1-MCM3 | P1.h | RLFB minichromosome maintenance complex component 3 - HPRD，Biogrid 12614612
MCM4 CDC21 | CDC54 | MGC33310 | P1-CDC21 | hCdc21 minichromosome maintenance complex component 4 两个杂交 BioGRID 12614612
MCM7 CDABP0042 |cdc47 |MCM2 |P1.1-MCM3 |P1CDC47 |p85mcm |PNAS-146 minichromosome maintenance complex component 7 - HPRD，Biogrid 12614612
MEN1 meai |SCG2 multiple endocrine neoplasia I Menin与Ask互动。 BIND 15374998
ORC1L HSORC1 | ORC1 | PARC1 起源识别综合体，亚基1状（酵母） 两个杂交 BioGRID 12614612
ORC2L ORC2 origin recognition complex, subunit 2-like (yeast) - HPRD，Biogrid 12614612
ORC4L ORC4 |ORC4P origin recognition complex, subunit 4-like (yeast) Affinity Capture-Western BioGRID 12614612
ORC5L ORC5 | ORC5P | ORC5T origin recognition complex, subunit 5-like (yeast) 两个杂交 BioGRID 12614612
ORC6L ORC6 原点识别综合体，亚基6类（酵母） Affinity Capture-Western
两个杂交		 BioGRID 12614612


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG CELL CYCLE 128 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME激活前的副本TIVE COMPLEX 31 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE 421 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE MITOTIC 325 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL CYCLE CHECKPOINTS 124 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME M G1 TRANSITION 81 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G1 S TRANSITION 112 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC G1 G1 S PHASES 137 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MITOTIC M M G1 PHASES 172 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DNA REPLICATION 192 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ACTIVATION OF ATR IN RESPONSE TO REPLICATION STRESS 38 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G2 M检查点 45 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NEWMAN ERCC6 TARGETS UP 26 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ODONNELL TFRC TARGETS DN 139 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ODONNELL TARGETS OF MYC AND TFRC DN 45 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIDUS METASTASIS UP 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TANG SENESCENCE TP53 TARGETS DN 57 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAMAI APOPTOSIS VIA TRAIL UP 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSTY CERVICAL CANCER PROLIFERATION CLUSTER 140 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FERREIRA EWINGS SARCOMA UNSTABLE VS STABLE UP 167 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH PROLIFERATION 147 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL FLI1 9 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REN BOUND BY E2F 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOREAUX MULTIPLE MYELOMA BY TACI DN 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kamminga EZH2目标 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE INCIPIENT UP 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SU TESTIS 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 8HR UP 105 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 14HR UP 156 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1 AUTOCRINE TARGETS UP 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1 EXOGENOUS TARGETS DN 120 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG FOXP3 TARGETS IN THYMUS UP 196 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG BREAST CANCER PROGENITORS UP 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG GLIOBLASTOMA PLASTICITY UP 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITEFORD PEDIATRIC CANCER MARKERS 116 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COLINA TARGETS OF 4EBP1 AND 4EBP2 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ISHIDA E2F TARGETS 53 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G23 UP 52 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOURNIER ACINAR DEVELOPMENT LATE 2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GREGORY SYNTHETIC LETHAL WITH IMATINIB 145 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION UP 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-30-3p 270 277 1A,m8 hsa-miR-30a-3p cuuucagucggauguugcagc
hsa-miR-30e-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC