基因页面:RALBP1
总结吗?
GeneID | 10928年 |
象征 | RALBP1 |
同义词 | RIP1 | RLIP1 | RLIP76 |
描述 | ralA结合蛋白1 |
参考 | MIM: 605801|HGNC: HGNC: 9841|运用:ENSG00000017797|HPRD: 09013|织女:OTTHUMG00000131596 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 18 p11.3 |
帕斯卡假定值 | 0.003 |
夏洛克假定值 | 0.011 |
胎儿β | -1.178 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg18989081 | 18 | 9474805 | RALBP1 | 2.93 e-9 | -0.009 | 2.05 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RALBP1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
能 | 0.52 | 0.31 |
SYT17 | 0.50 | 0.43 |
FER1L6 | 0.48 | 0.37 |
PTGER3 | 0.48 | 0.40 |
ANKRD6 | 0.47 | 0.35 |
MS4A8B | 0.46 | 0.28 |
SGCZ | 0.46 | 0.27 |
GRIK1 | 0.46 | 0.41 |
SLIT3 | 0.45 | 0.37 |
CX3CL1 | 0.45 | 0.34 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SH2D2A | -0.26 | -0.28 |
RPL14 | -0.25 | -0.24 |
RPL18 | -0.25 | -0.28 |
RPS19P3 | -0.25 | -0.25 |
RPL19P12 | -0.24 | -0.25 |
RPS13P2 | -0.24 | -0.24 |
RPS23 | -0.24 | -0.24 |
RPS6 | -0.24 | -0.26 |
RPL28 | -0.24 | -0.29 |
RPS16P1 | -0.24 | -0.29 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AP2A2 | ADTAB | CLAPA2 | HIP9 | HYPJ | adaptor-related蛋白复合物2,α2亚基 | RLIP76与alpha-adaptin交互。 | 绑定 | 10910768 |
AP2M1 | AP50 | CLAPM1 | mu2 | adaptor-related蛋白复合物2μ1亚基 | RLIP76与mu-2交互。 | 绑定 | 10910768 |
CASP8 | ALPS2B | CAP4 | FLICE | FLJ17672 | |马赫MCH5 | MGC78473 | 半胱天冬酶8日apoptosis-related半胱氨酸肽酶 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12887920 |
CCNB1 | CCNB | 细胞周期蛋白B1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12775724 |
EPN1 | - - - - - - | epsin 1 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12775724 |
GTF3A | AP2 | TFIIIA | 通用转录因子iii a | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12775724 |
HOOK2 | FLJ26218 | HK2 | 钩同族体2(果蝇) | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
HSF1 | HSTF1 | 热休克转录因子1 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 12621024 |
HSP90AA1 | FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89一半寿命| | LAP2 | 热休克蛋白90 kdaα(胞质),类成员1 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12621024 |
麻木了 | S171 | 麻木同族体(果蝇) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12775724 |
RAC1 | MGC111543 | MIG5 | TC-25 | p21-Rac1 | ras-related C3肉毒杆菌毒素基质1(ρ的家庭,小三磷酸鸟苷结合蛋白Rac1) | Rac1与RLIP76交互。 | 绑定 | 7673236 |
RAC1 | MGC111543 | MIG5 | TC-25 | p21-Rac1 | ras-related C3肉毒杆菌毒素基质1(ρ的家庭,小三磷酸鸟苷结合蛋白Rac1) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7673236 |
RALA | MGC48949 |、 | v-ral猴白血病病毒致癌基因相同器官(ras相关) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7673236 |
RALA | MGC48949 |、 | v-ral猴白血病病毒致癌基因相同器官(ras相关) | RalA与RalBP1交互。 | 绑定 | 15592429 |
RALA | MGC48949 |、 | v-ral猴白血病病毒致癌基因相同器官(ras相关) | RalA与RLIP76交互。 | 绑定 | 7673236 |
RALB | - - - - - - | v-ral猴白血病病毒致癌基因同族体B (ras相关;三磷酸鸟苷结合蛋白) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 7673236 |
RALB | - - - - - - | v-ral猴白血病病毒致癌基因同族体B (ras相关;三磷酸鸟苷结合蛋白) | RalB与RLIP76交互。 | 绑定 | 7673236 |
REPS1 | RALBP1 | RALBP1 Eps域包含1相关联 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 9395447 |
REPS2 | POB1 | 包含2 RALBP1 Eps相关领域 | 亲和力Capture-Western 重新组成复杂 |
BioGRID | 9422736 |
SYNJ2BP | ARIP2 | FLJ11271 | FLJ41973 | OMP25 | synaptojanin 2结合蛋白 | 重新组成复杂 2台混合动力 |
BioGRID | 11882656|15451561 |
肿瘤坏死因子 | DIF | tnf | TNFA | TNFSF2 | 肿瘤坏死因子(TNF超科,2) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12887920 |
TNFRSF1A | CD120a |基维辛迪| MGC19588 | TBP1 | TNF-R | TNF-R-I | TNF-R55 | TNFAR | TNFR1 | TNFR55 | TNFR60 |过去| p55-R | p60 | 肿瘤坏死因子受体超家族,成员1 | RIP1 TNFR1交互。 | 绑定 | 15247912 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG通路在癌症 | 328年 | 259年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG胰腺癌 | 70年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA RAC1通路 | 23 | 16 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BIOCARTA RAS途径 | 23 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
圣肿瘤坏死因子通路 | 29日 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
圣FAS信号通路 | 65年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID CDC42 REG通路 | 30. | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID RAC1 REG通路 | 38 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ρgtpase REACTOME信号 | 113年 | 81年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迪亚兹慢性MEYLOGENOUS白血病 | 1382年 | 904年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS基本DN | 455年 | 304年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质DN | 460年 | 312年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HOEBEKE淋巴干细胞DN | 86年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过小道HAMAI细胞凋亡 | 584年 | 356年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN SCHLOSSER血清反应 | 712年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRUETZMANN胰腺癌起来 | 358年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HATADA甲基化在肺癌 | 390年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CHEOK应对高清MTX DN | 24 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FLECHNER PBL肾移植排斥和好的DN | 51 | 35 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FLECHNER活检肾移植好的VS捐赠 | 555年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
THEILGAARD中性粒细胞在皮肤伤口DN | 225年 | 163年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
麦地那SMARCA4目标 | 44 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
程印的雌二醇 | 110年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王肿瘤侵袭性了 | 374年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN YOSHIMURA MAPK8目标 | 366年 | 257年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
八木AML和T 8 21易位 | 368年 | 247年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PILON KLF1目标了 | 504年 | 321年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
洛佩兹翻译通过FN1信号 | 35 | 21 | 所有SZGR 2.0基因通路 |