基因页：AFG3L2
概括？
| 基因 | 10939 |
| 象征 | AFG3L2 |
| 同义词 | SCA28 | SPAX5 |
| 描述 | AFG3如矩阵AAA肽酶亚基2 |
| 参考 | MIM：604581|HGNC：HGNC：315|ENSEMBL：ENSG00000141385|HPRD：05205|Vega：Otthumg00000131695 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 18p11 |
| Pascal P值 | 0.721 |
| Sherlock P值 | 0.68 |
| 胎儿β | -0.769 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG20012885 | 18 | 12377404 | AFG3L2 | 9.33e-5 | -0.28 | 0.027 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C3orf59 | 0.85 | 0.75 |
| PTPRO | 0.82 | 0.73 |
| FZD4 | 0.82 | 0.67 |
| CSRP2 | 0.80 | 0.57 |
| SDK1 | 0.79 | 0.70 |
| pde4d | 0.79 | 0.72 |
| GLRA2 | 0.77 | 0.70 |
| STK32B | 0.77 | 0.71 |
| vldlr | 0.77 | 0.68 |
| panx1 | 0.77 | 0.74 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.55 | -0.66 |
| SLC16A11 | -0.53 | -0.57 |
| hepn1 | -0.53 | -0.59 |
| LHPP | -0.52 | -0.54 |
| RGN | -0.52 | -0.57 |
| AC018755.7 | -0.52 | -0.59 |
| HLA-F | -0.51 | -0.58 |
| TSC22D4 | -0.51 | -0.59 |
| S100B | -0.51 | -0.64 |
| Pacsin3 | -0.51 | -0.53 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Puiffe入侵被腹水DN抑制 | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过ELK3和HIF1A的总缺氧 | 142 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巴索B淋巴细胞网络 | 143 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cromer转移DN | 81 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |