概括
基因 10949
象征 HNRNPA0
同义词 HNRPA0
描述 异质核核糖核蛋白A0
参考 MIM:609409|HGNC:HGNC:5030|HPRD:17112|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q31
Pascal P值 7.298E-4
Sherlock P值 0.289

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C22orf30 0.94 0.94
RNF4 0.93 0.93
FAM120B 0.93 0.94
VPS39 0.93 0.93
DNAJC14 0.92 0.91
KIAA1409 0.92 0.93
Zranb1 0.92 0.93
阿达 0.92 0.92
Ankrd17 0.92 0.91
Exoc7 0.92 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.79 -0.84
MT-CO2 -0.79 -0.78
AF347015.31 -0.79 -0.78
AF347015.8 -0.77 -0.78
FXYD1 -0.76 -0.77
higd1b -0.76 -0.78
ifi27 -0.75 -0.76
AF347015.33 -0.75 -0.73
mt-cyb -0.75 -0.73
AF347015.27 -0.74 -0.75

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003723 RNA结合 塔斯 7585247
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000398 核mRNA剪接,通过剪接体 经验 12226669
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 塔斯 7585247
去:0030530 异质核核糖核蛋白复合物 塔斯 7585247

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 140 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA处理 161 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA剪接 111 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pramoonjago Sox4靶向DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1靶向 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN APC目标 77 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫迪海马产前 42 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧癌 83 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN 72 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G1 UP 113 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-194 227 233 1a HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
mir-221/222 353 359 1a HSA-MIR-221 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222 agcuacaucuggcuacugggucuc
HSA-MIR-221 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-25/32/92/363/367 1448 1454 1a HSA-MIR-25 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-376 433 440 1A,M8 HSA-MIR-376A aucauagaaaaauccacgu
HSA-MIR-376B aucauagaaaaauccauguu
mir-491 208 214 1a HSA-MIR-491 aguggggaacccuuccaugga
mir-493-5p 477 484 1A,M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-496 1295 1301 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-500 1377 1384 1A,M8 HSA-MIR-500 augcaccuggggaggagauucug