基因页:HNRNPA0
概括?
基因 | 10949 |
象征 | HNRNPA0 |
同义词 | HNRPA0 |
描述 | 异质核核糖核蛋白A0 |
参考 | MIM:609409|HGNC:HGNC:5030|HPRD:17112| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q31 |
Pascal P值 | 7.298E-4 |
Sherlock P值 | 0.289 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0032 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HNRNPA0_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C22orf30 | 0.94 | 0.94 |
RNF4 | 0.93 | 0.93 |
FAM120B | 0.93 | 0.94 |
VPS39 | 0.93 | 0.93 |
DNAJC14 | 0.92 | 0.91 |
KIAA1409 | 0.92 | 0.93 |
Zranb1 | 0.92 | 0.93 |
阿达 | 0.92 | 0.92 |
Ankrd17 | 0.92 | 0.91 |
Exoc7 | 0.92 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.79 | -0.84 |
MT-CO2 | -0.79 | -0.78 |
AF347015.31 | -0.79 | -0.78 |
AF347015.8 | -0.77 | -0.78 |
FXYD1 | -0.76 | -0.77 |
higd1b | -0.76 | -0.78 |
ifi27 | -0.75 | -0.76 |
AF347015.33 | -0.75 | -0.73 |
mt-cyb | -0.75 | -0.73 |
AF347015.27 | -0.74 | -0.75 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003723 | RNA结合 | 塔斯 | 7585247 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000398 | 核mRNA剪接,通过剪接体 | 经验 | 12226669 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 塔斯 | 7585247 | |
去:0030530 | 异质核核糖核蛋白复合物 | 塔斯 | 7585247 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 | 140 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome mRNA处理 | 161 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome mRNA剪接 | 111 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pramoonjago Sox4靶向DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wood EBV EBNA1靶向 | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN APC目标 | 77 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莫迪海马产前 | 42 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧癌 | 83 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小的BII淋巴细胞DN | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G1 UP | 113 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未注释的DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-194 | 227 | 233 | 1a | HSA-MIR-194 | uguaacagcaacuccauga |
mir-221/222 | 353 | 359 | 1a | HSA-MIR-221脑 | agcuacauugucugugggggguc |
HSA-MIR-222脑 | agcuacaucuggcuacugggucuc | ||||
HSA-MIR-221脑 | agcuacauugucugugggggguc | ||||
HSA-MIR-222脑 | agcuacaucuggcuacugggucuc | ||||
mir-25/32/92/363/367 | 1448 | 1454 | 1a | HSA-MIR-25脑 | Cauugcacuugucucggucuga |
HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
HSA-MIR-367 | Aauugcacuuuagcaaugga | ||||
HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||
mir-376 | 433 | 440 | 1A,M8 | HSA-MIR-376A | aucauagaaaaauccacgu |
HSA-MIR-376B | aucauagaaaaauccauguu | ||||
mir-491 | 208 | 214 | 1a | HSA-MIR-491脑 | aguggggaacccuuccaugga |
mir-493-5p | 477 | 484 | 1A,M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
mir-496 | 1295 | 1301 | 1a | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |
mir-500 | 1377 | 1384 | 1A,M8 | HSA-MIR-500 | augcaccuggggaggagauucug |