基因页:CBX1
Summary?
GeneID | 10951 |
象征 | CBX1 |
同义词 | cbx | hp1-beta | hp1hs-beta | hp1hsbeta | m31 | mod1 | p25beta |
描述 | Chromobox 1 |
参考 | MIM:604511|HGNC:HGNC:1551|ENSEMBL:ENSG00000108468|HPRD:05149|Vega:OTTHUMG00000150417 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q21.32 |
Pascal P值 | 0.002 |
Sherlock P值 | 0.515 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17073502 | CHR4 | 183431488 | CBX1 | 10951 | 0.05 | 反式 | ||
RS16900783 | CHR5 | 31245333 | CBX1 | 10951 | 0.15 | 反式 | ||
RS17141097 | CHR7 | 19338527 | CBX1 | 10951 | 0.11 | 反式 | ||
RS7135241 | CHR12 | 95163565 | CBX1 | 10951 | 0.03 | 反式 | ||
RS12591303 | CHR15 | 56761869 | CBX1 | 10951 | 0.09 | 反式 | ||
SNP_A-2279190 | 0 | CBX1 | 10951 | 0.03 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CBX1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 苏rce | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
arl5a | arflp5 |arl5 | ADP-核糖基化因子样5A | Two-hybrid | Biogrid | 12414990 |
C11orf30 | Emsy |FLJ90741 |GL002 | chromosome 11 open reading frame 30 | - | HPRD,Biogrid | 14651845 |
C1orf103 | FLJ11269 |RIF1 |RP11-96K19.1 | 染色体1开放阅读框103 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
CBX1 | CBX |hp1-beta |HP1HS-BETA |HP1HSBETA |M31 |mod1 |p25beta | Chromobox同源物1(HP1β同源果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 10747027|11336697 |
CBX3 | Hech |HP1-gamma |HP1HS-GAMMA | Chromobox同源物3(HP1 Gamma同源物,果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 11336697 |
CBX5 | HP1 |HP1A | chromobox homolog 5 (HP1 alpha homolog, Drosophila) | - | HPRD,Biogrid | 11336697 |
chaf1a | CAF-1 |CAF1 |CAF1B |CAF1P150 |MGC71229 |P150 | 染色质组装因子1,亚基A(P150) | - | HPRD | 10549285 |
DNMT1 | 目标|CXXC9 |DNMT |FLJ16293 |MCMT |MGC104992 | DNA(胞嘧啶-5-) - 甲基转移酶1 | - | HPRD,Biogrid | 12711675 |
DNMT3A | DNMT3A2 | M.HsaIIIA | DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 alpha | - | HPRD,Biogrid | 12711675 |
DNMT3B | ICF |M.Hsaiiib | DNA(胞嘧啶-5-) - 甲基转移酶3β | DNMT3B与HP1-BETA相互作用。这种相互作用是在小鼠DNMT3B1和人HP1-beta之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 15120635 |
DNMT3B | ICF |M.Hsaiiib | DNA(胞嘧啶-5-) - 甲基转移酶3β | - | HPRD,Biogrid | 12867029 |
Hist1h3c | H3.1 | H3/c | H3FC | 组蛋白簇1,H3C | - | HPRD | 11882902 |
MKI67 | 起亚|Ki-67 | 单克隆抗体KI-67鉴定的抗原 | PKI-67通过其C末端与HP1蛋白的CS结构域相互作用。这种相互作用是在人与小鼠的hp1-beta之间证明的相互作用上建模的。 | 绑定 | 11793364 |
PIM1 | PIM | PIM-1癌基因 | - | HPRD,Biogrid | 12111331 |
RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | 重构的复合物 | Biogrid | 12711675 |
RPL12 | - | 核糖体蛋白L12 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
SUV39H1 | KMT1A |MG44 |SUV39H | Variegation 3-9同源1(果蝇)的抑制剂 | - | HPRD,Biogrid | 10202156 |
TRIM24 | PTC6 |RNF82 |TF1A |tif1 |tif1a |tif1alpha |HTIF1 | 三方基序24 | - | HPRD,Biogrid | 10562550 |
Trim28 | FLJ29029 |kap1 |RNF96 |TF1B |tif1b | 三方基序28 | - | HPRD,Biogrid | 10562550|11336697 |
UCHL1 | park5 |pgp9.5 |UCH-L1 | 泛素羧酸末端酯酶L1(泛素硫酯酶) | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |