Summary
GeneID 10951
象征 CBX1
同义词 cbx | hp1-beta | hp1hs-beta | hp1hsbeta | m31 | mod1 | p25beta
描述 Chromobox 1
参考 MIM:604511|HGNC:HGNC:1551|ENSEMBL:ENSG00000108468|HPRD:05149|Vega:OTTHUMG00000150417
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q21.32
Pascal P值 0.002
Sherlock P值 0.515
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

部分即遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17073502 CHR4 183431488 CBX1 10951 0.05 反式
RS16900783 CHR5 31245333 CBX1 10951 0.15 反式
RS17141097 CHR7 19338527 CBX1 10951 0.11 反式
RS7135241 CHR12 95163565 CBX1 10951 0.03 反式
RS12591303 CHR15 56761869 CBX1 10951 0.09 反式
SNP_A-2279190 0 CBX1 10951 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 苏rce PubMed ID
arl5a arflp5 |arl5 ADP-核糖基化因子样5A Two-hybrid Biogrid 12414990
C11orf30 Emsy |FLJ90741 |GL002 chromosome 11 open reading frame 30 - HPRD,Biogrid 14651845
C1orf103 FLJ11269 |RIF1 |RP11-96K19.1 染色体1开放阅读框103 Two-hybrid Biogrid 16169070
CBX1 CBX |hp1-beta |HP1HS-BETA |HP1HSBETA |M31 |mod1 |p25beta Chromobox同源物1(HP1β同源果蝇) - HPRD,Biogrid 10747027|11336697
CBX3 Hech |HP1-gamma |HP1HS-GAMMA Chromobox同源物3(HP1 Gamma同源物,果蝇) - HPRD,Biogrid 11336697
CBX5 HP1 |HP1A chromobox homolog 5 (HP1 alpha homolog, Drosophila) - HPRD,Biogrid 11336697
chaf1a CAF-1 |CAF1 |CAF1B |CAF1P150 |MGC71229 |P150 染色质组装因子1,亚基A(P150) - HPRD 10549285
DNMT1 目标|CXXC9 |DNMT |FLJ16293 |MCMT |MGC104992 DNA(胞嘧啶-5-) - 甲基转移酶1 - HPRD,Biogrid 12711675
DNMT3A DNMT3A2 | M.HsaIIIA DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 alpha - HPRD,Biogrid 12711675
DNMT3B ICF |M.Hsaiiib DNA(胞嘧啶-5-) - 甲基转移酶3β DNMT3B与HP1-BETA相互作用。这种相互作用是在小鼠DNMT3B1和人HP1-beta之间的相互作用上建模的。 绑定 15120635
DNMT3B ICF |M.Hsaiiib DNA(胞嘧啶-5-) - 甲基转移酶3β - HPRD,Biogrid 12867029
Hist1h3c H3.1 | H3/c | H3FC 组蛋白簇1,H3C - HPRD 11882902
MKI67 起亚|Ki-67 单克隆抗体KI-67鉴定的抗原 PKI-67通过其C末端与HP1蛋白的CS结构域相互作用。这种相互作用是在人与小鼠的hp1-beta之间证明的相互作用上建模的。 绑定 11793364
PIM1 PIM PIM-1癌基因 - HPRD,Biogrid 12111331
RB1 OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 视网膜细胞瘤1 重构的复合物 Biogrid 12711675
RPL12 - 核糖体蛋白L12 Two-hybrid Biogrid 16169070
SUV39H1 KMT1A |MG44 |SUV39H Variegation 3-9同源1(果蝇)的抑制剂 - HPRD,Biogrid 10202156
TRIM24 PTC6 |RNF82 |TF1A |tif1 |tif1a |tif1alpha |HTIF1 三方基序24 - HPRD,Biogrid 10562550
Trim28 FLJ29029 |kap1 |RNF96 |TF1B |tif1b 三方基序28 - HPRD,Biogrid 10562550|11336697
UCHL1 park5 |pgp9.5 |UCH-L1 泛素羧酸末端酯酶L1(泛素硫酯酶) Two-hybrid Biogrid 16169070


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
IGARASHI ATF4 TARGETS DN 90 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 All SZGR 2.0 genes in this pathway
AKL HTLV1感染 27 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa转变为可逆DN 29 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 All SZGR 2.0 genes in this pathway
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP 117 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP UP 69 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应DN 712 443 All SZGR 2.0 genes in this pathway
patil肝癌 747 453 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana BRCA2 PCC网络 423 265 All SZGR 2.0 genes in this pathway
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shen Smarca2目标 424 268 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori大型BII淋巴细胞向上 86 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori未成熟B淋巴细胞DN 90 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori EMU Myc淋巴瘤发作时间 110 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 All SZGR 2.0 genes in this pathway
golub所有vs aml up 24 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK 63 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ly老龄过早的DN 30 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Xu GH1自分泌目标 268 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
XU GH1外源目标DN 120 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fujii YBX1靶向DN 202 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chang Core血清反应 212 128 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 All SZGR 2.0 genes in this pathway
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G123 UP 45 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 All SZGR 2.0 genes in this pathway
开罗肝母细胞瘤 207 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束 1103 714 All SZGR 2.0 genes in this pathway
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 All SZGR 2.0 genes in this pathway
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway