Gene Page:PNRC1

概括?
基因 10957
Symbol PNRC1
Synonyms B4-2|PNAS-145|PROL2|PRR2
Description proline rich nuclear receptor coactivator 1
Reference MIM:606714|HGNC:HGNC:17278|Ensembl:ENSG00000146278|HPRD:08412|Vega:OTTHUMG00000015191
Gene type protein-coding
Map location 6q15
Pascal p-value 0.621
Fetal beta 0.126

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV：GWASDB Genome-wide Association Studies GWASdb records for schizophrenia
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
死神:胎儿(13 - 26 postconception周),ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
TIAL1 0.89 0.90
XPO1 0.88 0.90
LUC7L2 0.88 0.89
SF3B1 0.88 0.91
UHRF2 0.87 0.90
PRPF4B 0.87 0.90
DDX46 0.87 0.89
SUZ12 0.87 0.90
SENP6 0.87 0.90
GPBP1 0.87 0.89
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AF347015.31 -0.74 -0.84
MT-CO2 -0.73 -0.84
AF347015.27 -0.72 -0.82
FXYD1 -0.71 -0.82
AF347015.33 -0.71 -0.81
AF347015.8 -0.71 -0.82
MT-CYB -0.70 -0.81
IFI27 -0.70 -0.83
AF347015.15 -0.68 -0.80
HIGD1B -0.68 -0.81

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005515 protein binding TAS 7578250
生物过程 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0006355 regulation of transcription, DNA-dependent IEA -
去：0006350 transcription IEA -
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005634 nucleus TAS 7578250

Section V. Pathway annotation

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
PARENT MTOR SIGNALING UP 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE LIVE UP 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC UP 185 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION ERYTHROCYTE UP 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION SUSTAINDED IN ERYTHROCYTE UP 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TIEN INTESTINE PROBIOTICS 24HR DN 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE FIMA UP 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 UP 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS F UP 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN UP 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 DN 156 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA HIF1A DN 110 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 AND HIF1A UP 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES CORE NINE CORRELATED 100 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT SERUM RESPONSE 60 MCF10A 57 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG RESPONSE TO IKK INHIBITOR AND TNF UP 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 1 UP 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西葫芦转移DN 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA CENTRAL CLOCK 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CLOCK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NING CHRONIC OBSTRUCTIVE PULMONARY DISEASE UP 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIBA RESPONSE TO TSA 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 common 77 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN UP 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PODAR RESPONSE TO ADAPHOSTIN UP 147 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION B 53 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUIZ TNC TARGETS UP 153 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG CORE SERUM RESPONSE DN 209 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR UP 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML WITH T 8 21 TRANSLOCATION 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEIN ESR1 TARGETS 85 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 0 76 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KARLSSON TGFB1 TARGETS DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIRSCH CELLULAR TRANSFORMATION SIGNATURE UP 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 UP 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 36HR 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY 1839 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position miRNA ID miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-101 168 174 1A HSA-MIR-101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
miR-144 167 174 1A,m8 hsa-miR-144 UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG
miR-19 331 338 1A,m8 hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b ugugcaaauccaugcaaaacuga
miR-219 439 445 1A hsa-miR-219brain UGAUUGUCCAAACGCAAUUCU
miR-26 202 208 m8 hsa-miR-26abrain UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
hsa-miR-26bSZ uucaaguaauucaggauagguu
miR-369-3p 144 151 1A,m8 hsa-miR-369-3p AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU
hsa-miR-369-3p AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU
mir-374 145 151 m8 hsa-miR-374 UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG
miR-381 270 276 1A hsa-miR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
hsa-miR-381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir-495 224 230 1A hsa-miR-495brain AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU