基因页:TMed10
Summary?
GeneID | 10972 |
Symbol | TMed10 |
同义词 | p24(delta)| S31I125 | S31III125 | TMP21 | TMP-21-I | P23 | P24D1 |
描述 | 跨膜P24运输蛋白10 |
参考 | MIM:605406|HGNC:HGNC:16998|ENSEMBL:ENSG00000170348|HPRD:12013|Vega:Otthumg00000171771 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q24.3 |
Pascal P值 | 0.447 |
Sherlock P值 | 0.766 |
胎儿β | 0.457 |
DMG | 1(#研究) |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG11074549 | 14 | 75642944 | TMed10 | 8.58e-5 | -0.349 | 0.026 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TMED10_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16641999 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0045055 | 规范的分泌途径 | ISS | 神经递质(GO期限:7) | - |
GO:0016192 | vesicle-mediated transport | IEA | - | |
去:0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
GO:0048199 | vesicle targeting, to, from or within Golgi | ISS | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
去:0005792 | microsome | ISS | - | |
去:0005793 | ER-Golgi中间室 | 艾达 | 15308636 | |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
GO:0005801 | cis-Golgi network | ISS | - | |
GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | ISS | - | |
GO:0042589 | 扎原颗粒膜 | ISS | - | |
GO:0042470 | 黑色素体 | IEA | - |
部分诉通路注释
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124/506 | 2768 | 2774 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-214 | 2027 | 2034 | 1A,M8 | HSA-MIR-214脑 | acagcaggcacagacaggcag |
mir-31 | 112 | 119 | 1A,M8 | HSA-MIR-31 | Aggcaagaugcuggcauagcug |
mir-330 | 568 | 574 | 1a | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |
miR-495 | 3222 | 3228 | M8 | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
mir-544 | 3316 | 3322 | 1a | HSA-MIR-544 | auucugcauuuuuuagcaagu |