Summary
GeneID 10972
Symbol TMed10
同义词 p24(delta)| S31I125 | S31III125 | TMP21 | TMP-21-I | P23 | P24D1
描述 跨膜P24运输蛋白10
参考 MIM:605406|HGNC:HGNC:16998|ENSEMBL:ENSG00000170348|HPRD:12013|Vega:Otthumg00000171771
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q24.3
Pascal P值 0.447
Sherlock P值 0.766
胎儿β 0.457
DMG 1(#研究)

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 1

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG11074549 14 75642944 TMed10 8.58e-5 -0.349 0.026 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IPI 16641999
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0045055 规范的分泌途径 ISS 神经递质(GO期限:7) -
GO:0016192 vesicle-mediated transport IEA -
去:0015031 蛋白质运输 IEA -
GO:0048199 vesicle targeting, to, from or within Golgi ISS -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000139 高尔基膜 IEA -
去:0005792 microsome ISS -
去:0005793 ER-Golgi中间室 艾达 15308636
去:0005794 高尔基体 IEA -
GO:0005801 cis-Golgi network ISS -
GO:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 ISS -
GO:0042589 扎原颗粒膜 ISS -
GO:0042470 黑色素体 IEA -

部分诉通路注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
LIU SOX4 TARGETS UP 137 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
周的炎症反应生活 485 293 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC3靶向DN 536 332 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌 1821年 933 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Provenzani转移DN 136 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Creighton Akt1通过mtor向上信号传导 34 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP 117 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向 1037 673 All SZGR 2.0 genes in this pathway
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BENPORATH NANOG TARGETS 988 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Myc Max目标 775 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shen Smarca2目标 424 268 All SZGR 2.0 genes in this pathway
美味PLASMA CELL VS B LYMPHOCYTE UP 78 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK 63 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MLL CBP融合DN的王目标 45 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FAELT B CLL具有VH重排DN 48 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sesto对UV C8的反应 72 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kaab失败的心房DN 141 99 All SZGR 2.0 genes in this pathway
大脑衰老 262 186 All SZGR 2.0 genes in this pathway
welcsh brca1靶向 198 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway
抗原表现中的Pellicciotta HDAC 64 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1靶向DN 543 317 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53目标DN 593 372 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌 973 570 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hsiao家政基因 389 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
米利假足型haptotaxis dn 668 419 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Keshelava多种耐药性 88 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束 1103 714 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇的时间反应17 181 101 All SZGR 2.0 genes in this pathway
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lu eszh2靶向DN 414 237 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Demagalhaes老化 55 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124/506 2768 2774 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-214 2027 2034 1A,M8 HSA-MIR-214 acagcaggcacagacaggcag
mir-31 112 119 1A,M8 HSA-MIR-31 Aggcaagaugcuggcauagcug
mir-330 568 574 1a HSA-MIR-330 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
miR-495 3222 3228 M8 HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-544 3316 3322 1a HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu