概括
基因 10973
象征 ASCC3
同义词 ASC1P200 | Helic1 | RNAH
描述 激活信号协整1个复合亚基3
参考 MIM:614217|HGNC:HGNC:18697|ENSEMBL:ENSG00000112249|HPRD:09980|HPRD:16805|Vega:Otthumg0000000015279
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q16
Pascal P值 0.107
Sherlock P值 0.501
胎儿β 0.091
DMG 2(#研究)
主持人 皮质

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 2
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG03664139 6 101329504 ASCC3 -0.032 0.38 DMG:Nishioka_2013
CG03664139 6 101329504 ASCC3 1.86E-9 -0.023 1.58e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZNF513 0.95 0.95
trabd 0.93 0.91
CPSF3L 0.93 0.93
Spire2 0.92 0.93
ZNF446 0.92 0.93
ARRDC1 0.92 0.91
b4galnt4 0.92 0.92
ZNF517 0.92 0.93
GTPBP3 0.92 0.92
LRRC45 0.91 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.71 -0.80
AF347015.31 -0.70 -0.78
MT-CO2 -0.68 -0.77
AF347015.33 -0.67 -0.76
AF347015.8 -0.67 -0.78
mt-cyb -0.66 -0.76
C5orf53 -0.64 -0.66
AF347015.21 -0.64 -0.80
AF347015.15 -0.64 -0.75
COPZ2 -0.62 -0.70

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井与中度DN 110 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAIN NFKB信号 75 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对Serm或Fulvestrant的反应 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ghandhi直接辐照 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因