基因页:ASCC3
概括?
基因 | 10973 |
象征 | ASCC3 |
同义词 | ASC1P200 | Helic1 | RNAH |
描述 | 激活信号协整1个复合亚基3 |
参考 | MIM:614217|HGNC:HGNC:18697|ENSEMBL:ENSG00000112249|HPRD:09980|HPRD:16805|Vega:Otthumg0000000015279 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q16 |
Pascal P值 | 0.107 |
Sherlock P值 | 0.501 |
胎儿β | 0.091 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 皮质 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03664139 | 6 | 101329504 | ASCC3 | -0.032 | 0.38 | DMG:Nishioka_2013 | |
CG03664139 | 6 | 101329504 | ASCC3 | 1.86E-9 | -0.023 | 1.58e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ASCC3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZNF513 | 0.95 | 0.95 |
trabd | 0.93 | 0.91 |
CPSF3L | 0.93 | 0.93 |
Spire2 | 0.92 | 0.93 |
ZNF446 | 0.92 | 0.93 |
ARRDC1 | 0.92 | 0.91 |
b4galnt4 | 0.92 | 0.92 |
ZNF517 | 0.92 | 0.93 |
GTPBP3 | 0.92 | 0.92 |
LRRC45 | 0.91 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.71 | -0.80 |
AF347015.31 | -0.70 | -0.78 |
MT-CO2 | -0.68 | -0.77 |
AF347015.33 | -0.67 | -0.76 |
AF347015.8 | -0.67 | -0.78 |
mt-cyb | -0.66 | -0.76 |
C5orf53 | -0.64 | -0.66 |
AF347015.21 | -0.64 | -0.80 |
AF347015.15 | -0.64 | -0.75 |
COPZ2 | -0.62 | -0.70 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化了井与中度DN | 110 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JAIN NFKB信号 | 75 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Frasor对Serm或Fulvestrant的反应 | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ghandhi直接辐照 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |