基因页：rab32
概括？
| 基因 | 10981 |
| 象征 | rab32 |
| 同义词 | - |
| 描述 | Rab32，成员Ras Oncogene家族 |
| 参考 | MIM：612906|HGNC：HGNC：9772|Ensembl：ENSG00000118508|HPRD：06700|Vega：Otthumg0000000015755 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6Q24.3 |
| Pascal P值 | 0.224 |
| 胎儿β | 0.495 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG04113075 | 6 | 146865487 | rab32 | 1.113E-4 | -4.623 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2469564 | CHR15 | 76489954 | rab32 | 10981 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PEX14 | 0.83 | 0.82 |
| LONP1 | 0.82 | 0.83 |
| ARFRP1 | 0.82 | 0.80 |
| MIB2 | 0.82 | 0.79 |
| ANAPC2 | 0.82 | 0.81 |
| DAPK3 | 0.81 | 0.81 |
| Pick1 | 0.81 | 0.80 |
| polr2e | 0.81 | 0.80 |
| thap4 | 0.80 | 0.80 |
| DDX41 | 0.79 | 0.78 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.67 | -0.62 |
| AF347015.31 | -0.66 | -0.61 |
| MT-CO2 | -0.63 | -0.59 |
| mt-cyb | -0.61 | -0.56 |
| AF347015.33 | -0.59 | -0.54 |
| AF347015.8 | -0.59 | -0.55 |
| AF347015.27 | -0.59 | -0.58 |
| AF347015.2 | -0.59 | -0.53 |
| clec2b | -0.58 | -0.55 |
| higd1b | -0.58 | -0.54 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
| 去：0004672 | 蛋白激酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
| 去：0007264 | 小GTPase介导的信号转导 | IEA | - | |
| 去：0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005739 | 线粒体 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王对贝克索烯DN的响应 | 29 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML复发预后 | 35 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HALMOS CEBPA目标 | 52 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML生存 | 129 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞 | 156 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦加维因结肠癌的甲基化沉默 | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bredemeyer抹布发信号不是通过ATM提高 | 62 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer生存DN | 175 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤C D DN | 252 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamanaka胶质母细胞瘤生存 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kamikubo Myeloid MN1网络 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verhaak胶质母细胞瘤间充质 | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-30-5p | 238 | 245 | 1A，M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
| HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
| HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
| HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
| HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||