基因页:SDS
概括?
基因 | 10993 |
象征 | SDS |
同义词 | SDH |
描述 | 丝氨酸脱水酶 |
参考 | MIM:182128|HGNC:HGNC:10691|Ensembl:ENSG00000135094|HPRD:01633|Vega:Otthumg00000169554 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q24.13 |
Pascal P值 | 9.755e-5 |
胎儿β | -1.765 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17455108 | CHR1 | 4724047 | SDS | 10993 | 0.01 | 反式 | ||
RS6703905 | CHR1 | 89656748 | SDS | 10993 | 0.01 | 反式 | ||
RS924019 | CHR3 | 184794255 | SDS | 10993 | 0.07 | 反式 | ||
RS17007771 | CHR4 | 124970238 | SDS | 10993 | 0.01 | 反式 | ||
RS17007781 | CHR4 | 124977313 | SDS | 10993 | 0.03 | 反式 | ||
RS1028198 | CHR4 | 124977733 | SDS | 10993 | 0.02 | 反式 | ||
RS226946 | CHR6 | 3717139 | SDS | 10993 | 0.19 | 反式 | ||
RS226966 | CHR6 | 3720300 | SDS | 10993 | 0.14 | 反式 | ||
RS3803656 | CHR16 | 81551505 | SDS | 10993 | 0 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SDS_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SLC25A11 | 0.90 | 0.90 |
MRPL38 | 0.89 | 0.91 |
TMEM222 | 0.88 | 0.88 |
UQCRC1 | 0.88 | 0.87 |
MRPS18B | 0.88 | 0.84 |
AES | 0.88 | 0.88 |
PSMD8 | 0.88 | 0.84 |
C21orf33 | 0.87 | 0.85 |
NIT1 | 0.86 | 0.83 |
FBXW5 | 0.86 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.60 | -0.49 |
MT-ATP8 | -0.55 | -0.42 |
AL139819.3 | -0.55 | -0.49 |
AC010300.1 | -0.54 | -0.59 |
NSBP1 | -0.54 | -0.53 |
AF347015.21 | -0.53 | -0.38 |
AF347015.8 | -0.53 | -0.37 |
AF347015.26 | -0.52 | -0.38 |
AF347015.2 | -0.52 | -0.34 |
mt-cyb | -0.49 | -0.34 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg甘氨酸丝氨酸和苏氨酸代谢 | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg半胱氨酸和蛋氨酸代谢 | 34 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 | 143 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Weng Por靶向肝脏DN | 20 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO TH1细胞毒性模块 | 114 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |