概括
基因 10998
象征 SLC27A5
同义词 acsb | acsvl6 | bacs | bal | facvl3 | fatp-5 | fatp5 | vlacsr | vlcs-h2 | vlcsh2
描述 Solute Carrier家族27成员5
参考 MIM:603314|HGNC:HGNC:10999|ENSEMBL:ENSG00000083807|HPRD:04499|Vega:Otthumg00000183543
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.43
Pascal P值 0.03
Sherlock P值 0.038
胎儿β -0.307

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
tbca 0.85 0.87
PPIH 0.84 0.83
Sarnp 0.83 0.83
CFDP1 0.83 0.80
催眠 0.83 0.78
DNAJC8 0.82 0.81
SUMO2 0.81 0.83
PFDN2 0.81 0.81
CXORF26 0.80 0.79
LSM8 0.80 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
tinagl1 -0.60 -0.71
HLA-F -0.60 -0.67
HLA-E -0.59 -0.69
GPER -0.58 -0.68
SLC6A12 -0.58 -0.68
fgr -0.57 -0.67
ATP10A -0.57 -0.67
AF347015.9 -0.56 -0.67
AF347015.2 -0.55 -0.66
预告片 -0.55 -0.64

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG初级胆汁酸生物合成 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg ppar信号通路 69 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胆汁酸和胆汁盐代谢 27 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过7Alpha羟化胆固醇的胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 15 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过24羟基胆固醇的胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 19 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过小径dn 186 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤副本编号 100 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1目标DN 47 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc TGFA DN 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee肝癌ACOX1 DN 65 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Dena DN 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G123 DN 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向DN 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因