基因页:聊天
概括?
基因 | 1103 |
象征 | 聊天 |
同义词 | Choctase | CMS1A | CMS1A2 | CMS6 |
描述 | 胆碱O-乙酰转移酶 |
参考 | MIM:118490|HGNC:HGNC:1912|ENSEMBL:ENSG00000070748|HPRD:07510|Vega:Otthumg0000000018198 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q11.2 |
Pascal P值 | 0.51 |
胎儿β | -1.749 |
支持 | 神经递质代谢 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:7 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CHAT_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FBXO5 | 0.96 | 0.86 |
TTK | 0.95 | 0.87 |
PLK4 | 0.95 | 0.88 |
地狱 | 0.95 | 0.77 |
梅尔克 | 0.95 | 0.82 |
KIF23 | 0.94 | 0.83 |
Gins1 | 0.94 | 0.83 |
Brip1 | 0.94 | 0.83 |
SMC4 | 0.94 | 0.87 |
CEP55 | 0.94 | 0.80 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.51 | -0.78 |
C5orf53 | -0.51 | -0.73 |
pth1r | -0.50 | -0.74 |
AIFM3 | -0.50 | -0.77 |
FBXO2 | -0.50 | -0.67 |
aldoc | -0.49 | -0.73 |
AF347015.31 | -0.48 | -0.82 |
AF347015.27 | -0.48 | -0.81 |
CA4 | -0.48 | -0.74 |
TNFSF12 | -0.48 | -0.68 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004102 | 胆碱O-乙酰转移酶活性 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0008415 | 酰基转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0030182 | 神经元分化 | IEA | 神经元(GO期限:8) | - |
去:0007274 | 神经肌肉突触传播 | IEA | 神经元,突触(GO期限:7) | - |
GO:0043179 | 有节奏的激发 | IEA | 突触(GO期限:9) | - |
GO:0042136 | 神经递质生物合成过程 | IEA | 神经元,轴突,突触,神经递质(GO术语级别:9) | - |
去:0007529 | 在神经肌肉连接处建立突触特异性 | IEA | 神经元,突触(GO期限:11) | - |
GO:0016358 | 树突开发 | IEA | 神经突,树突(GO期限:11) | - |
去:0007517 | 肌肉发育 | IEA | - | |
去:0007628 | 成人步行行为 | IEA | - | |
去:0007622 | 有节奏的行为 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0043025 | 细胞体 | IEA | Axon,Dendrite(GO期限:4) | - |
去:0005634 | 核 | 塔斯 | 10861222 | |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 10861222 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG甘油磷脂代谢 | 77 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组磷脂代谢 | 198 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PC的Reactome合成 | 18 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组甘油磷脂生物合成 | 82 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
跨化学突触的反应组传播 | 186 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome神经递质释放周期 | 34 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组乙酰胆碱神经递质释放周期 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 196 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A4 | 196 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Noushmehr GBM种系突变 | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |