概括
基因 1103
象征 聊天
同义词 Choctase | CMS1A | CMS1A2 | CMS6
描述 胆碱O-乙酰转移酶
参考 MIM:118490|HGNC:HGNC:1912|ENSEMBL:ENSG00000070748|HPRD:07510|Vega:Otthumg0000000018198
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q11.2
Pascal P值 0.51
胎儿β -1.749
支持 神经递质代谢

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:7

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FBXO5 0.96 0.86
TTK 0.95 0.87
PLK4 0.95 0.88
地狱 0.95 0.77
梅尔克 0.95 0.82
KIF23 0.94 0.83
Gins1 0.94 0.83
Brip1 0.94 0.83
SMC4 0.94 0.87
CEP55 0.94 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.51 -0.78
C5orf53 -0.51 -0.73
pth1r -0.50 -0.74
AIFM3 -0.50 -0.77
FBXO2 -0.50 -0.67
aldoc -0.49 -0.73
AF347015.31 -0.48 -0.82
AF347015.27 -0.48 -0.81
CA4 -0.48 -0.74
TNFSF12 -0.48 -0.68

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004102 胆碱O-乙酰转移酶活性 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0008415 酰基转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0030182 神经元分化 IEA 神经元(GO期限:8) -
去:0007274 神经肌肉突触传播 IEA 神经元,突触(GO期限:7) -
GO:0043179 有节奏的激发 IEA 突触(GO期限:9) -
GO:0042136 神经递质生物合成过程 IEA 神经元,轴突,突触,神经递质(GO术语级别:9) -
去:0007529 在神经肌肉连接处建立突触特异性 IEA 神经元,突触(GO期限:11) -
GO:0016358 树突开发 IEA 神经突,树突(GO期限:11) -
去:0007517 肌肉发育 IEA -
去:0007628 成人步行行为 IEA -
去:0007622 有节奏的行为 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0043025 细胞体 IEA Axon,Dendrite(GO期限:4) -
去:0005634 塔斯 10861222
去:0005737 细胞质 塔斯 10861222

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG甘油磷脂代谢 77 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组磷脂代谢 198 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PC的Reactome合成 18 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组甘油磷脂生物合成 82 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经递质释放周期 34 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组乙酰胆碱神经递质释放周期 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 196 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Noushmehr GBM种系突变 8 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因