SZGR2 - Beplay体育中心

Summary？

GeneID	11035
Symbol	RIPK3
同义词	RIP3
描述	受体相互作用丝氨酸/苏氨酸激酶3
参考	MIM：605817\|HGNC：HGNC：10021\|ENSEMBL：ENSG00000129465\|HPRD:09315\|Vega：Otthumg0000000029349
基因类型	蛋白质编码
地图位置	14Q11.2
Pascal P值	0.364
DEG P值	DEG:Sanders_2014:DS1_p=-0.142:DS1_beta=0.049300:DS2_p=5.62e-03:DS2_beta=-0.139:DS2_FDR=5.05e-02
胎儿β	-0.199
DMG	1（＃研究）
主持人	伏隔核基底神经节

Gene in Data Sources

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DEG：Sanders_2013	微阵列	使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列（LCLS）上的微阵列进行全基因组基因表达谱。
DMG：Wockner_2014	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。	4
GSMA_I	基因组扫描荟萃分析	PSR：0.047
网络	Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network	PPI网络中最短路径的贡献：0.0122

Section I. Genetics and epigenetics annotation

差异甲基化基因

探测	染色体	位置	最近的基因	p（dis）	beta（dis）	fdr（dis）	学习
CG13050240	14	24809068	RIPK3	2.56E-5	-0.513	0.017	DMG：Wockner_2014
CG13066043	14	24808987	RIPK3	1.298E-4	-0.341	0.03	DMG：Wockner_2014
cg20822579	14	24809073	RIPK3	1.75E-4	-0.397	0.033	DMG：Wockner_2014
CG11781986	14	24808787	RIPK3	3.815E-4	-0.327	0.043	DMG：Wockner_2014

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0000166	核苷酸结合	IEA		-
去：0004704	NF-kappab诱导激酶活性	IEA		-
去：0003713	转录共激活因子活性	塔斯		10339433
去：0005524	ATP结合	IEA		-
去：0004674	protein serine/threonine kinase activity	IEA		-
去：0004674	protein serine/threonine kinase activity	塔斯		10339433
GO：0016740	反式ferase activity	IEA		-
Biological process	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0006464	蛋白质修饰过程	塔斯		10358032
GO:0006468	蛋白氨基酸磷酸化	IEA		-
去：0007165	signal transduction	塔斯		10339433
去：0006915	apoptosis	IEA		-
去：0007249	i-kappab激酶/nf-kappab级联	IEA		-
去：0008624	通过细胞外信号诱导凋亡	塔斯		10339433
细胞分量	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005622	细胞内	IEA		-
去：0005737	cytoplasm	IEA		-

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
AIFM1	AIF \| MGC111425 \| PDCD8	apoptosis-inducing factor, mitochondrion-associated, 1	-	HPRD	14743216
atad3a	FLJ10709	ATPase家族，AAA域，包含3A	-	HPRD	14743216
CAPZB	CAPB \|cappb \|CAPZ \|MGC104401 \|MGC129749 \|MGC129750	上限蛋白（肌动蛋白丝）肌肉z线，β	-	HPRD	14743216
DBN1	D0S117E \| DKFZp434D064	德雷布林1	-	HPRD	14743216
EEF1D	EF-1D \| EF1D \| FLJ20897 \| FP1047	真核翻译伸长因子1增量（鸟嘌呤核苷酸交换蛋白）	-	HPRD	14743216
GNG12	FLJ31352 \|FLJ34695	鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白），伽马12	-	HPRD	14743216
HNRNPA1	HNRPA1 \|MGC102835	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1	-	HPRD	14743216
HSPA8	HSC54 \|HSC70 \|HSC71 \|HSP71 \|HSP73 \|HSPA10 \|lap1 \|MGC131511 \|MGC29929 \|NIP71	热休克70KDA蛋白8	-	HPRD	14743216
mprip	KIAA0864 \| M-RIP \| RHOIP3 \| p116Rip	肌球蛋白磷酸酶Rho相互作用蛋白	-	HPRD	14743216
MRCL3	MLCB \|MRLC3	肌球蛋白调节轻链MRCL3	-	HPRD	14743216
myl6	ESMLC \| LC17-GI \| LC17-NM \| LC17A \| LC17B \| MLC1SM \| MLC3NM \| MLC3SM	肌球蛋白，轻链6，碱，平滑肌和非肌肉	-	HPRD	14743216
RIPK1	FLJ39204 \|RIP \|RIP1	受体（TNFRSF） - 互动丝氨酸 - 硫代激酶1	-	HPRD，Biogrid	10339433
sc	KIAA1905	Scinderin	-	HPRD	14743216
SPECC1L	KIAA0376	SPECC1-like	-	HPRD	14743216
SPTBN1	ELF \| SPTB2 \| betaSpII	光谱，β，非肉毒杆菌1	-	HPRD	14743216
TIAF1	majn \|myo18a \|myspdz \|SPR210	TGFB1诱导的抗凋亡因子1	-	HPRD	14743216
tiCAM1	MGC35334 \|prvtirb \|TICAM-1 \|trif	Toll样受体适配器分子1	-	HPRD，Biogrid	15064760
TNFRSF1A	CD120A \|FPF \|MGC19588 \|TBP1 \|TNF-R \|tnf-r-i \|TNF-R55 \|tnfar \|TNFR1 \|TNFR55 \| TNFR60 \| p55 \| p55-R \| p60	肿瘤坏死因子受体超家族，成员1a	-	HPRD，Biogrid	10339433
TPM3	FLJ41118 \|MGC14582 \|MGC3261 \|MGC72094 \|Nem1 \|OK/SW-CL.5 \|TM-5 \|TM3 \|TM30 \|TM30NM \| TPMsk3 \| TRK \| hscp30	肌球蛋白3	-	HPRD	14743216
TRAF2	MGC：45012 \|陷阱\|陷阱3	TNF受体相关因子2	-	HPRD，Biogrid	10339433
tuba3c	tuba2 \|BA408E5.3	微管蛋白，α3C	-	HPRD	14743216
tubb2b	DKFZP566F223 \|FLJ98847 \|MGC8685 \|tubb-paralog \|BA506K6.1	微管蛋白，β2B	-	HPRD	14743216

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
kegg胞质DNA感应途径	56	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Trif介导的TLR3信号传导	74	54	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome RIP介导的NFKB通过DAI激活	18	15	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome先天免疫系统	279	178	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome免疫系统	933	616	All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌起来	1821年	933	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlesinger甲基化的癌症	88	64	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔卡拉凋亡	88	60	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Suz12目标	1038	678	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath EED目标	1062	725	All SZGR 2.0 genes in this pathway
与H3K27me3的Benporath ES	1118	744	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath PRC2目标	652	441	All SZGR 2.0 genes in this pathway
松本自然杀手差分	475	313	All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血早期祖先	532	309	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Firestein增殖	175	125	All SZGR 2.0 genes in this pathway
4EBP1和4EBP2的COLINA目标	356	214	All SZGR 2.0 genes in this pathway
陈代谢综合征网络	1210	725	All SZGR 2.0 genes in this pathway
马顿人维甲酸的反应	857	456	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN	1972年	1213	All SZGR 2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D	882	506	All SZGR 2.0 genes in this pathway
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标	289	184	All SZGR 2.0 genes in this pathway

基因页：RIPK3