基因页：RCC1
概括？
| 基因 | 1104 |
| 象征 | RCC1 |
| 同义词 | CHC1 | RCC1-I | SNHG3-RCC1 |
| 描述 | 染色体凝结的调节剂1 |
| 参考 | MIM：179710|HGNC：HGNC：1913|ENSEMBL：ENSG00000180198|HPRD：01559|Vega：Otthumg00000003645 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p36.1 |
| Pascal P值 | 0.002 |
| 胎儿β | 1.244 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG01551176 | 1 | 28844397 | RCC1 | 6.6e-8 | -0.011 | 1.63E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7514423 | CHR1 | 29778112 | RCC1 | 1104 | 0.18 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RNF169 | 0.93 | 0.94 |
| 恩 | 0.93 | 0.90 |
| DCAF7 | 0.93 | 0.93 |
| CNOT6 | 0.93 | 0.93 |
| crkrs | 0.92 | 0.94 |
| WHSC1 | 0.92 | 0.91 |
| sin3a | 0.92 | 0.93 |
| EIF4EBP2 | 0.92 | 0.90 |
| myst3 | 0.92 | 0.93 |
| KDM5A | 0.92 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.66 | -0.73 |
| FXYD1 | -0.65 | -0.83 |
| AF347015.31 | -0.65 | -0.83 |
| S100B | -0.64 | -0.78 |
| MT-CO2 | -0.64 | -0.83 |
| ifi27 | -0.63 | -0.80 |
| AF347015.27 | -0.63 | -0.79 |
| AF347015.33 | -0.62 | -0.78 |
| AIFM3 | -0.62 | -0.69 |
| HLA-F | -0.62 | -0.68 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| chka | CHK |CKI | 胆碱激酶α | - | HPRD | 12062430 |
| CSNK1A1 | CK1 |HLCDGP1 |Pro2975 | 酪蛋白激酶1，α1 | - | HPRD，Biogrid | 12062430 |
| Hist2H2BE | GL105 |H2B |H2B.1 |H2B/Q |H2BFQ |MGC119802 |MGC119804 |MGC129733 |MGC129734 | 组蛋白集群2，H2BE | - | HPRD | 11375490 |
| KPNA3 | IPOA4 |srp1gamma |srp4 |HSRP1 | 核桃蛋白α3（importin alpha 4） | - | HPRD，Biogrid | 10744690 |
| PTMA | MGC104802 |TMSA | 螺赛蛋白，α | - | HPRD | 11310559 |
| 跑 | ARA24 |GSP1 |TC4 | RAN，RAS成员Ras Oncogene家族 | 共晶结构 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 7891706|10369786 |10811801|11336674 |
| 跑 | ARA24 |GSP1 |TC4 | RAN，RAS成员Ras Oncogene家族 | - | HPRD | 10369786|12194828 |
| RANBP1 | htf9a |MGC88701 | 运行结合蛋白1 | - | HPRD | 7616957 |
| ranbp3 | DKFZP586I1520 | 运行结合蛋白3 | - | HPRD，Biogrid | 11932251 |
| RCC1 | CHC1 |RCC1-i | 染色体凝结的调节剂1 | - | HPRD | 11336674 |
| tal1 | SCL |TCL5 |BHLHA17 |TAL-1 | T细胞急性淋巴细胞性白血病1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 16407974 |
| XPO1 | CRM1 |DKFZP686B1823 | Exportin 1（CRM1同源物，酵母） | - | HPRD，Biogrid | 11932251 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Biocarta Ranms途径 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID MYC活动途径 | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期 | 125 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期的后期 | 104 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 受甲基化DN调节的Missiaglia | 122 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rashi对电离辐射5的响应5 | 147 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| liang造血细胞数大与微小的DN | 45 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 | 176 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巴索B淋巴细胞网络 | 143 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Peng Leucine剥夺DN | 187 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schuhmacher MYC的目标 | 80 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cheok对汞和LD MTX DN的反应 | 21 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭雷帕霉素反应dn | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JAIN NFKB信号 | 75 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee老化新皮层DN | 80 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染8小时 | 105 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时 | 156 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng通过ERCC6对H2O2的响应 | 17 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WELCSH BRCA1靶向DN | 141 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng对H2O2的响应 | 71 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng通过ERCC6 DN对H2O2的响应 | 46 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染30分钟DN | 150 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |