基因页：CHD1
概括？
| 基因 | 1105 |
| 象征 | CHD1 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 染色体瘤酶DNA结合蛋白1 |
| 参考 | MIM：602118|HGNC：HGNC：1915|ENSEMBL：ENSG00000153922|HPRD：03668|Vega：Otthumg00000162744 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q15-Q21 |
| Pascal P值 | 0.005 |
| Sherlock P值 | 0.809 |
| 胎儿β | 1.216 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG03255775 | 5 | 98265241 | CHD1 | 5.67E-10 | -0.013 | 8.96E-7 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS17572651 | CHR1 | 218943612 | CHD1 | 1105 | 0.15 | 反式 | ||
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | CHD1 | 1105 | 1.736E-6 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | CHD1 | 1105 | 0.15 | 反式 | ||
| RS11139334 | Chr9 | 84209393 | CHD1 | 1105 | 0.04 | 反式 | ||
| RS4112777 | CHR13 | 99281457 | CHD1 | 1105 | 0.1 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | CHD1 | 1105 | 7.602E-7 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KLC2 | 0.85 | 0.87 |
| panx2 | 0.84 | 0.78 |
| Rab3a | 0.79 | 0.84 |
| grin1 | 0.78 | 0.81 |
| KCNC3 | 0.78 | 0.80 |
| PDE4A | 0.78 | 0.81 |
| ATP1A1 | 0.78 | 0.80 |
| KCNJ11 | 0.77 | 0.77 |
| DCTN1 | 0.77 | 0.82 |
| AC021534.2 | 0.77 | 0.80 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.42 | -0.32 |
| AP002478.3 | -0.40 | -0.44 |
| Rab13 | -0.40 | -0.49 |
| GNG11 | -0.39 | -0.40 |
| ifi44 | -0.39 | -0.50 |
| AF347015.18 | -0.36 | -0.24 |
| C1orf54 | -0.36 | -0.38 |
| myl12a | -0.36 | -0.44 |
| 鼻孔 | -0.36 | -0.35 |
| C1orf61 | -0.36 | -0.43 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤DN | 136 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 渡边直肠癌放射疗法反应性DN | 92 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chow rassf1靶向 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Berenjeno由Rhoa Forever DN转变 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 | 167 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 皮肤上的theilgaard中性粒细胞 | 77 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramalho Stemness | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dazard对UV SCC DN的响应 | 123 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线响应集群D2 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 | 174 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标36小时DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SPI1和FLI1 DN的Juban目标 | 92 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |