概括
基因 11061
象征 Lect1
同义词 bricd3 | chm-i | chm1 | myets1
描述 白细胞细胞衍生趋化素1
参考 MIM:605147|HGNC:HGNC:17005|ENSEMBL:ENSG00000136110|HPRD:05511|Vega:Otthumg0000000016980
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q14.3
Pascal P值 0.001
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16869851 CHR4 20690056 Lect1 11061 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NDE1 0.77 0.68
CREB5 0.75 0.68
cdc25b 0.74 0.75
PSRC1 0.74 0.80
E2F1 0.71 0.72
CYTSB 0.71 0.77
sall1 0.71 0.65
CRTAP 0.70 0.67
SNX1 0.70 0.74
CHD1L 0.69 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KRT19 -0.32 -0.34
RP9P -0.32 -0.41
C3orf54 -0.31 -0.24
klhl1 -0.31 -0.10
Trim67 -0.30 -0.14
SATB2 -0.29 -0.02
IL32 -0.29 -0.22
Dact1 -0.28 -0.11
fblim1 -0.28 -0.22
AC087071.1 -0.28 -0.29

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
roversi神经胶质瘤副本编号 100 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
staege ewing家庭肿瘤 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 14 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC ICP,具有H3未甲基化的 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 126 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 137 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Noushmehr GBM被甲基化沉默 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因