基因页:Lect1
概括?
基因 | 11061 |
象征 | Lect1 |
同义词 | bricd3 | chm-i | chm1 | myets1 |
描述 | 白细胞细胞衍生趋化素1 |
参考 | MIM:605147|HGNC:HGNC:17005|ENSEMBL:ENSG00000136110|HPRD:05511|Vega:Otthumg0000000016980 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q14.3 |
Pascal P值 | 0.001 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16869851 | CHR4 | 20690056 | Lect1 | 11061 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LECT1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NDE1 | 0.77 | 0.68 |
CREB5 | 0.75 | 0.68 |
cdc25b | 0.74 | 0.75 |
PSRC1 | 0.74 | 0.80 |
E2F1 | 0.71 | 0.72 |
CYTSB | 0.71 | 0.77 |
sall1 | 0.71 | 0.65 |
CRTAP | 0.70 | 0.67 |
SNX1 | 0.70 | 0.74 |
CHD1L | 0.69 | 0.73 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KRT19 | -0.32 | -0.34 |
RP9P | -0.32 | -0.41 |
C3orf54 | -0.31 | -0.24 |
klhl1 | -0.31 | -0.10 |
Trim67 | -0.30 | -0.14 |
SATB2 | -0.29 | -0.02 |
IL32 | -0.29 | -0.22 |
Dact1 | -0.28 | -0.11 |
fblim1 | -0.28 | -0.22 |
AC087071.1 | -0.28 | -0.29 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
staege ewing家庭肿瘤 | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记DN | 138 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MEISSNER ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 14 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC ICP,具有H3未甲基化的 | 24 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 | 126 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 137 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Noushmehr GBM被甲基化沉默 | 50 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |