基因页：Sox30
概括？
| 基因 | 11063 |
| 象征 | Sox30 |
| 同义词 | - |
| 描述 | Sry-box 30 |
| 参考 | MIM：606698|HGNC：HGNC：30635|Ensembl：ENSG00000039600|HPRD：09461|Vega：Otthumg00000130247 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q33 |
| Pascal P值 | 0.751 |
| 胎儿β | -0.91 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00459 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01718 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| HOOI ST7靶向 | 94 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 韦伯甲基化的HCP成纤维细胞DN | 42 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 精子DN中的Weber甲基化HCP | 28 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-203.1 | 29 | 35 | M8 | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
| mir-374 | 504 | 510 | 1a | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |