SZGR2 - Beplay体育中心

总结吗?

GeneID	1107年
象征	CHD3
同义词	Mi-2a \| Mi2-ALPHA \| ZFH
描述	chromodomain解旋酶DNA结合蛋白3
参考	MIM: 602120\|HGNC: HGNC: 1918\|运用:ENSG00000170004\|HPRD: 09071\|织女:OTTHUMG00000150427
基因型	蛋白质编码
地图上的位置	17 p13.1
帕斯卡假定值	0.015
胎儿β	0.846
DMG	1(#研究)
支持	CompositeSet 达内尔FMRP目标染色质重塑基因

基因数据来源

基因集名称	基因的方法设置	描述	信息
简历:PGCnp	全基因组关联研究	GWAS
DMG: Montano_2016	全基因组DNA甲基化分析	这个数据集包括172复制与精神分裂症之间的联系论文认定。	1
网络	最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络	贡献在PPI网络最短路径:0.0278

部分即遗传学和表观遗传学注释

不同甲基化基因

探针	染色体	位置	最近的基因	P (dis)	β(dis)	罗斯福(dis)	研究
cg00066663	17	7792674	CHD3	4.38 e-5	-0.004	0.091	DMG: Montano_2016

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域

第三部分。基因本体论注释

分子功能	去的术语	证据	神经的关键词	PubMed ID
去:0000166	核苷酸绑定	国际能源机构		- - - - - -
去:0003677	DNA结合	助教		9326634
去:0003682	染色质绑定	国际能源机构		- - - - - -
去:0004003	ATP-dependent DNA解旋酶的活动	助教		9326634
去:0005515	蛋白结合	新闻学会		12505151\|15383276
去:0005524	ATP结合	国际能源机构		- - - - - -
去:0016787	水解酶活性	国际能源机构		- - - - - -
去:0016818	水解酶活性,作用于卤酸酐、酐	国际能源机构		- - - - - -
去:0008270	锌离子结合	NAS		9688266
去:0046872	金属离子结合	国际能源机构		- - - - - -
生物过程	去的术语	证据	神经的关键词	PubMed ID
去:0006333	染色质组装或拆卸	国际能源机构		- - - - - -
去:0006357	监管RNA聚合酶II启动子的转录	助教		9326634
去:0016568	染色质修饰	国际能源机构		- - - - - -
蜂窝组件	去的术语	证据	神经的关键词	PubMed ID
去:0000785	染色质	国际能源机构		- - - - - -
去:0005634	核	NAS		9688266

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员	别名B	官方全名B	实验	源	PubMed ID
ADH5	ADH-3 \| ADHX \| \|外籍家庭佣工GSNOR	乙醇脱氢酶5(第三类),气多肽	2台混合动力	BioGRID	16169070
ARS2	ASR2 \| MGC126427	砷酸耐药蛋白2	2台混合动力	BioGRID	16169070
ATPIF1	ATPI \| ATPIP IP \| \| MGC1167 \| MGC8898	atp酶抑制因子1	2台混合动力	BioGRID	16169070
BCL6	BCL5 \| BCL6A \| LAZ3 \| ZBTB27 \| ZNF51	b细胞慢性淋巴细胞白血病/淋巴瘤6	BCL6与Mi2交互。	绑定	15454082
BHLHB2	DEC1 \| SHARP-2 \| STRA13 \| Stra14 \| bHLHe40	基本helix-loop-helix域包含,B类,2	2台混合动力	BioGRID	16169070
C4orf17	DKFZp434G072	染色体4开放阅读框17	2台混合动力	BioGRID	16169070
C7orf36	GK003	7号染色体开放阅读框36	2台混合动力	BioGRID	16169070
CASP6	MCH2	半胱天冬酶6 apoptosis-related半胱氨酸肽酶	2台混合动力	BioGRID	16169070
CASP8	ALPS2B \| CAP4 \| FLICE \| FLJ17672 \| \|马赫MCH5 \| MGC78473	半胱天冬酶8日apoptosis-related半胱氨酸肽酶	2台混合动力	BioGRID	16169070
CPE	- - - - - -	羧肽酶E	2台混合动力	BioGRID	16169070
CRCT1	C1orf42 \| NICE-1	cysteine-rich c端1	2台混合动力	BioGRID	16169070
CREB1	分子\| MGC9284	营反应元件结合蛋白1	2台混合动力	BioGRID	16169070
CSTF2	cstf - 64	劈理的刺激因素,3 ' pre-RNA,亚基2,64 kda	2台混合动力	BioGRID	16169070
CTTN	EMS1 \| FLJ34459	cortactin	2台混合动力	BioGRID	16169070
FAM134A	C2orf17 \| DKFZp686C2379 \| MGC3035	134年家庭序列相似性,成员	2台混合动力	BioGRID	16169070
FBP2	MGC142192	的特性,6-bisphosphatase 2	2台混合动力	BioGRID	16169070
FUBP1	出口押汇\| FUBP	远上游元件结合蛋白1(保险丝)	2台混合动力	BioGRID	16169070
GPS2	AMF-1 \| MGC104294 \| MGC119287 \| MGC119288 \| MGC119289	G蛋白通路抑制2	2台混合动力	BioGRID	16169070
HABP4	IHABP4 \| Ki-1/57 \| MGC825 \| SERBP1L	透明质酸结合蛋白4	- - - - - -	HPRD, BioGRID	12505151
HABP4	IHABP4 \| Ki-1/57 \| MGC825 \| SERBP1L	透明质酸结合蛋白4	Ki-1/57与CHD-3交互。	绑定	12505151
HDAC1	DKFZp686H12203 \| GON-10 \| HD1 \| RPD3 \| RPD3L1	组蛋白脱乙酰酶1	- - - - - -	HPRD, BioGRID	9804427
HDAC2	RPD3 \| YAF1	组蛋白脱乙酰酶2	- - - - - -	HPRD, BioGRID	9804427
HSPH1	DKFZp686M05240 \| HSP105 \| HSP105A \| HSP105B \| KIAA0201 \| NY-CO-25	热休克蛋白质1 105 kda / 110 kda	2台混合动力	BioGRID	16169070
本土知识	CSA2 \| MGC59741 \|红色	本土知识的细胞因子,HLA二世的装置	2台混合动力	BioGRID	16169070
IKZF1	Hs.54452 \| IK1 \| IKAROS \| LYF1 \| PRO0758 \| ZNFN1A1 \| hIk-1	伊卡洛斯家族锌指1(伊卡洛斯飞船)	- - - - - -	HPRD	10204490
IKZF3	AIO \|艾俄洛斯\| ZNFN1A3	伊卡洛斯家族锌指3(艾俄洛斯)	- - - - - -	HPRD	10204490
IMMT	DKFZp779P1653 \| \|恩HMP MGC111146 \| P87 \| P87/89 \| P89 \| PIG4 \| PIG52	内在膜蛋白,线粒体(mitofilin)	2台混合动力	BioGRID	16169070
IVNS1ABP	DKFZp686K06216 \| FLARA3 \| FLJ10069 \| FLJ10411 \| FLJ10962 \| FLJ35593 \| FLJ36593 \| HSPC068 \| KIAA0850 \| ND1 \| NS-1 \| NS1-BP \| NS1BP	流感病毒NS1A结合蛋白	2台混合动力	BioGRID	16169070
KIF15	FLJ25667 \| HKLP2 \| KNSL7 \|纽约- br - 62	驱动蛋白家族成员15	2台混合动力	BioGRID	16169070
LUC7L2	CGI-59 \| cgi - 74 \| FLJ10657 \| LUC7B2	LUC7-like 2(酵母)	2台混合动力	BioGRID	16169070
MAFG	MGC13090 \| MGC20149	v-maf肌肉筋膜纤维肉瘤癌基因同族体G(禽流感)	2台混合动力	BioGRID	16169070
MAN2A2	MANA2X	甘露糖苷酶、α2类,成员2	2台混合动力	BioGRID	16169070
MBD2	DKFZp586O0821 \| DMTase \| NY-CO-41	methyl-CpG绑定域蛋白2	重新组成复杂	BioGRID	10444591
MBD3L1	MBD3L \| MGC138263 \| MGC138269	methyl-CpG绑定域蛋白存在	亲和力Capture-Western	BioGRID	15456747
MTA2	DKFZp686F2281 \| MTA1L1 \| PID	转移相关1家族,成员2	Co-purification	BioGRID	10444591
PAICS	现ADE2 \| ADE2H1 \| \| DKFZp781N1372 \| MGC1343 \| MGC5024 \|《国家	phosphoribosylaminoimidazole羧化酶,phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide合成酶	2台混合动力	BioGRID	16169070
PCMT1	- - - - - -	protein-L-isoaspartate O-methyltransferase (D-aspartate)	2台混合动力	BioGRID	16169070
PRG2为例	BMPG \| MBP \| MBP1 \| MGC14537	蛋白聚糖骨髓(自然杀伤细胞活化剂,嗜酸性粒细胞颗粒主要碱性蛋白)	2台混合动力	BioGRID	16169070
PRPF40A	FBP-11 \| FBP11 \| FLAF1 \| FLJ20585 \| FNBP3 \| HIP10 \| HYPA \| NY-REN-6	PRP40 pre-mRNA处理因素40同族体(酵母)	- - - - - -	HPRD	15383276
PSME1	IFI5111 \| MGC8628 \| PA28A \| PA28alpha \| REGalpha	蛋白酶体(prosome macropain)激活单元1 (PA28α)	2台混合动力	BioGRID	16169070
PTN	竖琴\| HBGF8 \| HBNF \| NEGF1	pleiotrophin	2台混合动力	BioGRID	16169070
PTPRS	PTPSIGMA	蛋白质酪氨酸磷酸酶、受体类型	2台混合动力	BioGRID	16169070
PUF60	冷杉\| FLJ31379 \| RoBPI \| SIAHBP1	60 kda poly-U绑定连接因素	2台混合动力	BioGRID	16169070
RAD21	FLJ25655 \| FLJ40596 \| HR21 \| HRAD21 \| KIAA0078 \| MCD1 \| NXP1 \| SCC1 \| hHR21	RAD21同族体(s .非洲酒)	Co-purification	BioGRID	12198550
RAD51	BRCC5 \| HRAD51 \| HsRad51 \| HsT16930 \| RAD51A \| RECA	RAD51同族体(RecA同族体,大肠杆菌)(酵母)	2台混合动力	BioGRID	16169070
RPL29	臀部\| HUMRPL29 \| MGC88589	核糖体蛋白气密性好	2台混合动力	BioGRID	16169070
SAFB	DKFZp779C1727 \| HAP \| HET \| SAFB1	支架附件B因子	2台混合动力	BioGRID	16169070
SAT1	坐在DC21 \| KFSD \| \| SSAT \| SSAT-1	亚精胺和精胺N1-acetyltransferase 1	2台混合动力	BioGRID	16169070
SATB1	- - - - - -	SATB同源框1	- - - - - -	HPRD	12374985
SDCCAG3	NY-CO-3	血清学定义结肠癌抗原3	2台混合动力	BioGRID	16169070
SERBP1	CGI-55 \| CHD3IP \| DKFZp564M2423 \| FLJ90489 \| HABP4L \| PAI-RBP1 \| PAIRBP1	SERPINE1信使rna结合蛋白1	- - - - - -	HPRD, BioGRID	12505151
SERBP1	CGI-55 \| CHD3IP \| DKFZp564M2423 \| FLJ90489 \| HABP4L \| PAI-RBP1 \| PAIRBP1	SERPINE1信使rna结合蛋白1	CGI-55与CHD-3交互。	绑定	12505151
SERF2	4 f5rel \| FAM2C \| FLJ20431 \| FLJ37527 \| FLJ38557 \| H4F5rel \| HsT17089 \| MGC48826	小EDRK-rich因子2	2台混合动力	BioGRID	16169070
SGSM2	KIAA0397 \| RUTBC1	小G蛋白信号调制器2	2台混合动力	BioGRID	16169070
SIRT6	SIR2L6	sirtuin蛋白(沉默的交配类型信息监管2同族体)6(酵母)	2台混合动力	BioGRID	16169070
SLC27A6	ACSVL2 \| DKFZp779M0564 \| FACVL2 \| FATP6 \| VLCS-H1	溶质载体家庭27(脂肪酸转运体),成员6	2台混合动力	BioGRID	16169070
SMARCA5	ISWI \| SNF2H \| WCRF135 \| hISWI \| hSNF2H	瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚科,成员5	Co-purification	BioGRID	12198550
SUMO1	DAP-1 \| GMP1 \| OFC10 \| PIC1 \| SENP2 \| SMT3 \| SMT3C \| SMT3H3 \| SUMO-1 \| UBL1	SMT3 mif抑制两个3同族体1(酵母)	SUMO-1与CHD3交互。	绑定	14609633
SUMO1	DAP-1 \| GMP1 \| OFC10 \| PIC1 \| SENP2 \| SMT3 \| SMT3C \| SMT3H3 \| SUMO-1 \| UBL1	SMT3 mif抑制两个3同族体1(酵母)	- - - - - -	HPRD	14609633
SUMO1	DAP-1 \| GMP1 \| OFC10 \| PIC1 \| SENP2 \| SMT3 \| SMT3C \| SMT3H3 \| SUMO-1 \| UBL1	SMT3 mif抑制两个3同族体1(酵母)	2台混合动力	BioGRID	10961991
SUMO2	HSMT3 \| MGC117191 \| SMT3B \| SMT3H2	SMT3 mif抑制两个3同族体2(酵母)	2台混合动力	BioGRID	16169070
THOC7	FLJ23445 \| NIF3L1BP1 \| fSAP24	THO复杂7同族体(果蝇)	2台混合动力	BioGRID	16169070
TNFRSF14	阿塔尔\| HVEA \| HVEM \| LIGHTR \| TR2	肿瘤坏死因子受体超家族成员14(疱疹病毒进入中介)	2台混合动力	BioGRID	16169070
TP53	FLJ92943 \| LFS1 \| TRP53 \| p53	肿瘤蛋白质p53	- - - - - -	HPRD, BioGRID	10961991
TP73	P73	肿瘤蛋白质p73	- - - - - -	HPRD, BioGRID	10961991
TRIM28	FLJ29029 \| KAP1 \| RNF96 \| TF1B \| TIF1B	三方motif-containing 28	2台混合动力	BioGRID	16169070
TSPAN6	T245 \| TM4SF6 \| TSPAN-6	tetraspanin 6	2台混合动力	BioGRID	16169070
竞技场队伍	HsT2651 \| PALB \| TBPA	转体基因	2台混合动力	BioGRID	16169070
TXNDC9	APACD	硫氧还蛋白域包含9个	2台混合动力	BioGRID	16169070
UBA3	DKFZp566J164 \| MGC22384 \| UBE1C \| hUBA3	ubiquitin-like修改器激活酶3	2台混合动力	BioGRID	16169070
UBE2I	C358B7.1 \| P18 \| UBC9	ubiquitin-conjugating酶E2I (UBC9同系物、酵母)	- - - - - -	HPRD, BioGRID	14609633
UBE2I	C358B7.1 \| P18 \| UBC9	ubiquitin-conjugating酶E2I (UBC9同系物、酵母)	Ubc9与CHD3交互。	绑定	14609633
XRCC4	- - - - - -	x射线在中国仓鼠细胞修复补充缺陷修复4	2台混合动力	BioGRID	16169070
ZHX1	- - - - - -	锌手指和同源框1	- - - - - -	HPRD	15383276

部分诉通路注释

路径名称	通道尺寸	# SZGR 2.0基因通路	信息
PID HDAC抚慰心灵的途径	66年	50	所有SZGR 2.0基因通路
ONKEN葡萄膜黑色素瘤了	783年	507年	所有SZGR 2.0基因通路
奥斯瓦尔德造血干细胞在胶原凝胶	233年	161年	所有SZGR 2.0基因通路
HOEBEKE淋巴干细胞	95年	64年	所有SZGR 2.0基因通路
MULLIGHAN MLL签名1	380年	236年	所有SZGR 2.0基因通路
MULLIGHAN MLL签名2	418年	263年	所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN	514年	330年	所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展12小时DN	57	45	所有SZGR 2.0基因通路
FLECHNER PBL肾移植好的VS捐赠	151年	One hundred.	所有SZGR 2.0基因通路
BAELDE糖尿病肾病DN	434年	302年	所有SZGR 2.0基因通路
道格拉斯BMI1目标了	566年	371年	所有SZGR 2.0基因通路
西方肾上腺皮质肿瘤DN	546年	362年	所有SZGR 2.0基因通路
ASGHARZADEH神经母细胞瘤穷人生存DN	46	30.	所有SZGR 2.0基因通路
KARLSSON TGFB1目标了	127年	78年	所有SZGR 2.0基因通路
李BMP2目标了	745年	475年	所有SZGR 2.0基因通路
KOINUMA SMAD2或SMAD3的目标	824年	528年	所有SZGR 2.0基因通路
GOBERT少突细胞分化DN	1080年	713年	所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭	目标位置			microrna的ID	microrna的seq
microrna的家庭	UTR开始	UTR结束	匹配方法	microrna的ID	microrna的seq
mir - 491	90年	96年	m8	hsa - mir - 491^大脑	AGUGGGGAACCCUUCCAUGAGGA
mir - 504	252年	258年	m8	hsa - mir - 504	AGACCCUGGUCUGCACUCUAU
miR-7	256年	263年	1、m8	hsa-miR-7^深圳	UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUG

深圳:microrna在精神分裂症患者的大脑皮层比较差异表达与控制样本使用微阵列。点击在这里看到深圳的列表相关的microrna。
大脑:microrna的表达大脑基于microrna的微阵列表达研究。点击在这里看到大脑相关的microrna的列表。

基因页面:CHD3