基因页：TPPP
概括？
| 基因 | 11076 |
| 象征 | TPPP |
| 同义词 | tppp/p25 | tppp1 | p24 | p25 | p25alpha |
| 描述 | 微管蛋白聚合促进蛋白 |
| 参考 | MIM：608773|HGNC：HGNC：24164|ENSEMBL：ENSG00000171368|HPRD：18522|Vega：Otthumg00000131011 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5p15.3 |
| Pascal P值 | 0.86 |
| Sherlock P值 | 0.047 |
| 胎儿β | -2.129 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG26666609 | 5 | 691161 | TPPP | 1.271E-4 | 0.352 | 0.03 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| POT1 | 0.88 | 0.86 |
| ptges3 | 0.86 | 0.86 |
| TMEM68 | 0.86 | 0.83 |
| FBXL5 | 0.86 | 0.83 |
| MAPKSP1 | 0.86 | 0.83 |
| BBS10 | 0.85 | 0.84 |
| C3orf38 | 0.85 | 0.84 |
| NMD3 | 0.85 | 0.81 |
| ORC4L | 0.85 | 0.85 |
| ube2n | 0.84 | 0.82 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.26 | -0.70 | -0.70 |
| MT-CO2 | -0.70 | -0.67 |
| AF347015.33 | -0.69 | -0.67 |
| AF347015.8 | -0.68 | -0.68 |
| AF347015.2 | -0.67 | -0.65 |
| mt-cyb | -0.67 | -0.67 |
| AF347015.15 | -0.67 | -0.67 |
| AF347015.18 | -0.65 | -0.69 |
| AF347015.27 | -0.62 | -0.63 |
| tinagl1 | -0.61 | -0.65 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15590652 | |
| 去：0008017 | 微管结合 | ISS | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001578 | 微管束的形成 | ISS | - | |
| GO：0032273 | 蛋白聚合的阳性调节 | 艾达 | 15590652 | |
| GO：0031334 | 蛋白质复合物组装的正调控 | ISS | - | |
| GO：0046785 | 微管聚合 | ISS | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005625 | 可溶性部分 | ISS | - | |
| GO：0048471 | 细胞质的核周区 | 艾达 | 15590652 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌5p15 Amplicon | 26 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bild E2F3致癌特征 | 246 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-1/206 | 70 | 76 | M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
| HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
| HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||