基因页:triobp
概括?
基因 | 11078 |
象征 | triobp |
同义词 | dfnb28 | hrihfb2122 | tap68 | tara | dj37e16.4 |
描述 | 三人和F-肌动蛋白结合蛋白 |
参考 | MIM:609761|HGNC:HGNC:17009|Ensembl:ENSG00000100106|HPRD:11028|Vega:Otthumg00000150657 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q13.1 |
Pascal P值 | 0.822 |
Sherlock P值 | 0.48 |
DEG P值 | DEG:Maycox_2009:cc_ba10_fold_change = 1.13:cc_ba10_disease_p = 0.0075:hbb_ba9_fold_change = 1.19:hbb_ba9_disease_p = 0.0292 |
胎儿β | 1.845 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DEG:Maycox_2009 | 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 | 我们包括了51个基因,其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。 | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TRIOBP_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
mpdz | 0.68 | 0.70 |
GPR75 | 0.66 | 0.68 |
Arhgef10 | 0.65 | 0.69 |
PIK3C2A | 0.65 | 0.64 |
IQGAP1 | 0.64 | 0.65 |
SLC41A1 | 0.64 | 0.67 |
FAM120C | 0.64 | 0.62 |
ZC3HAV1 | 0.64 | 0.63 |
WWC3 | 0.63 | 0.67 |
RREB1 | 0.63 | 0.62 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RP11-3P17.1 | -0.33 | -0.36 |
RPL31 | -0.31 | -0.32 |
FAM159B | -0.31 | -0.31 |
RPL35 | -0.31 | -0.35 |
DDTL | -0.31 | -0.30 |
PFDN5 | -0.30 | -0.30 |
RPL27 | -0.30 | -0.32 |
RPL13AP22 | -0.30 | -0.37 |
AC087071.1 | -0.30 | -0.27 |
GADD45GIP1 | -0.29 | -0.32 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCIAN反转TP53和TP73 DN的目标 | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向DN | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 | 92 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindvall通过Tert Up永生 | 78 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild MYC致癌签名 | 206 | 117 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Takeer吉西他滨抗性DN | 122 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi缺氧 | 140 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |