概括
基因 11078
象征 triobp
同义词 dfnb28 | hrihfb2122 | tap68 | tara | dj37e16.4
描述 三人和F-肌动蛋白结合蛋白
参考 MIM:609761|HGNC:HGNC:17009|Ensembl:ENSG00000100106|HPRD:11028|Vega:Otthumg00000150657
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q13.1
Pascal P值 0.822
Sherlock P值 0.48
DEG P值 DEG:Maycox_2009:cc_ba10_fold_change = 1.13:cc_ba10_disease_p = 0.0075:hbb_ba9_fold_change = 1.19:hbb_ba9_disease_p = 0.0292
胎儿β 1.845
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DEG:Maycox_2009 微阵列确定验尸后30000多个mRNA转录本的表达 我们包括了51个基因,其表达变化在两个精神分裂症队列之间很常见。
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
mpdz 0.68 0.70
GPR75 0.66 0.68
Arhgef10 0.65 0.69
PIK3C2A 0.65 0.64
IQGAP1 0.64 0.65
SLC41A1 0.64 0.67
FAM120C 0.64 0.62
ZC3HAV1 0.64 0.63
WWC3 0.63 0.67
RREB1 0.63 0.62
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RP11-3P17.1 -0.33 -0.36
RPL31 -0.31 -0.32
FAM159B -0.31 -0.31
RPL35 -0.31 -0.35
DDTL -0.31 -0.30
PFDN5 -0.30 -0.30
RPL27 -0.30 -0.32
RPL13AP22 -0.30 -0.37
AC087071.1 -0.30 -0.27
GADD45GIP1 -0.29 -0.32

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCIAN反转TP53和TP73 DN的目标 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向DN 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 92 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindvall通过Tert Up永生 78 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染18小时DN 178 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takeer吉西他滨抗性DN 122 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi缺氧 140 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因