基因页：CHD4
概括？
| 基因 | 1108 |
| 象征 | CHD4 |
| 同义词 | CHD-4 | Mi-2b | Mi2-Beta |
| 描述 | 染色体瘤酶DNA结合蛋白4 |
| 参考 | MIM：603277|HGNC：HGNC：1919|ENSEMBL：ENSG00000111642|HPRD：04472|Vega：Otthumg00000169164 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12p13 |
| Pascal P值 | 0.803 |
| Sherlock P值 | 0.478 |
| TADA P值 | 0.026 |
| 胎儿β | 0.178 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 染色质重塑基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Girard_2011 | 整个外显子组测序分析 | 数据集包括从14个精神分裂症概率及其父母的外部发现的15个DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CHD4 | CHR12 | 6707226 | G | 一个 | NM_001273 | p.576r> w | 错过 | 精神分裂症 | DNM：Girard_2011 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MX1 | 0.82 | 0.82 |
| TAPBPL | 0.80 | 0.85 |
| ephx1 | 0.80 | 0.80 |
| TMBIM1 | 0.79 | 0.87 |
| TNFSF13 | 0.79 | 0.86 |
| CYP11A1 | 0.79 | 0.81 |
| tmprss3 | 0.78 | 0.73 |
| SLC14A1 | 0.78 | 0.77 |
| GJB6 | 0.77 | 0.85 |
| agxt2l1 | 0.77 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PHF14 | -0.49 | -0.76 |
| nkiras2 | -0.49 | -0.71 |
| RTF1 | -0.49 | -0.71 |
| CRMP1 | -0.48 | -0.72 |
| PCDHB18 | -0.48 | -0.73 |
| Zwilch | -0.48 | -0.69 |
| PJA1 | -0.48 | -0.69 |
| DPF1 | -0.48 | -0.71 |
| ZNF821 | -0.48 | -0.71 |
| NOL4 | -0.48 | -0.70 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Atr | frp1 |mec1 |sckl |SCKL1 | 共济失调的毛细血管扩张和RAD3相关 | - | HPRD，Biogrid | 10545197 |
| HDAC1 | DKFZP686H12203 |gon-10 |HD1 |RPD3 |RPD3L1 | 组蛋白脱乙酰基酶1 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 9804427|10220385 |12920132 |
| HDAC2 | RPD3 |yaf1 | 组蛋白脱乙酰基酶2 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 9804427|10545197 |12493763 |
| ikzf1 | HS.54452 |IK1 |Ikaros |lyf1 |Pro0758 |Znfn1a1 |Hik-1 | Ikaros家庭锌指1（Ikaros） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12015313 |
| ikzf2 | Helios |MGC34330 |Znf1a2 |Znfn1a2 | Ikaros家庭锌指2（Helios） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12015313 |
| ikzf3 | AIO |蒜泥蛋黄酱|Znfn1a3 | ikaros家族锌指3（Aiolos） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12015313 |
| ikzf4 | EOS |KIAA1782 |Znfn1a4 | Ikaros家庭锌指4（EOS） | - | HPRD，Biogrid | 12015313 |
| MBD3 | - | 甲基-CPG结合结构域蛋白3 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12354758 |
| MTA1 | - | 转移相关1 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 12920132 |
| MTA2 | DKFZP686F2281 |mta1l1 |pid | 转移相关的1个家庭，成员2 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 12920132 |
| SATB1 | - | SATB HONEOBOX 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共同分级 |
Biogrid | 12374985 |
| Trim27 | RFP |RNF76 | 三方基序27 | - | HPRD | 14530259 |
| XRN1 | DKFZP434P0721 |DKFZP686B22225 |DKFZP686F19113 |FLJ41903 |Sep1 | 5'-3'Exoribonclelease 1 | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID HDAC Classi途径 | 66 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Puiffe入侵被腹水抑制 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房5 6WK DN | 137 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房6 7WK UP | 197 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LUI甲状腺癌PAX8 PPARG UP | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal TGFB1靶向 | 169 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LUI甲状腺癌簇1 | 51 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Caffarel对THC 8HR 3 DN的响应 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发和癌症Box1 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除 | 195 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UEDA PERIFERAL CHICK | 169 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WELCSH BRCA1靶向DN | 141 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤D | 89 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Holleman daunorubicin B全部 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Holleman daunorubicin全部 | 7 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |