概括
基因 11091
象征 WDR5
同义词 Big-3 | CFAP89 | SWD3
描述 WD重复域5
参考 MIM:609012|HGNC:HGNC:12757|ENSEMBL:ENSG00000196363|HPRD:10614|Vega:Otthumg00000131707
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9q34
Pascal P值 0.427
Sherlock P值 0.925
胎儿β -0.351
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06198335 9 137001969 WDR5 3.92E-9 -0.019 2.44e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RNF216 0.88 0.88
BTN2A1 0.87 0.86
0.87 0.87
GTF3C1 0.87 0.87
WWP2 0.86 0.88
FTSJD2 0.86 0.85
HDLBP 0.86 0.83
FBXO18 0.86 0.84
SUPT6H 0.86 0.86
FAM120B 0.86 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.76 -0.75
AF347015.31 -0.73 -0.73
MT-CO2 -0.72 -0.72
C1orf54 -0.71 -0.72
higd1b -0.70 -0.69
FXYD1 -0.70 -0.68
ifi27 -0.68 -0.65
AF347015.8 -0.68 -0.69
AF347015.33 -0.67 -0.66
AF347015.27 -0.66 -0.68

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID昼夜节路 16 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Furukawa Dusp6靶向PCI35 DN 74 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tong与PTTG1互动 57 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1 DN的Garcia目标 176 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 97 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
boudoukha由IGF2BP2绑定 111 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因