基因页：NUPL2
概括？
| 基因 | 11097 |
| 象征 | NUPL2 |
| 同义词 | CG1 | NLP-1 | NLP_1 | HCG1 |
| 描述 | 核孔蛋白喜欢2 |
| 参考 | HGNC：HGNC：17010|ENSEMBL：ENSG00000136243|HPRD：14855|Vega：Otthumg0000000096955 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7p15 |
| Pascal P值 | 0.113 |
| Sherlock P值 | 0.877 |
| 胎儿β | 0.207 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 伏隔核基底神经节 元 |
| 支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NUPL2 | CHR7 | 23221811 | 一个 | aggcagcaaccgc | NM_007342 | 。 | 框架外插入 | 精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG20723844 | 7 | 23220997 | NUPL2 | 3.056E-4 | 0.282 | 0.04 | DMG：Wockner_2014 |
| CG19941686 | 7 | 23221979 | NUPL2 | 6.89E-8 | -0.01 | 1.68e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PSMB4 | 0.92 | 0.92 |
| DCTPP1 | 0.92 | 0.94 |
| cuedc2 | 0.91 | 0.93 |
| PSMA7 | 0.91 | 0.93 |
| POP7 | 0.91 | 0.91 |
| SF3B5 | 0.91 | 0.94 |
| PSMB3 | 0.91 | 0.88 |
| UFD1L | 0.90 | 0.91 |
| C16orf91 | 0.90 | 0.90 |
| C12orf10 | 0.90 | 0.89 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.26 | -0.69 | -0.79 |
| AF347015.15 | -0.67 | -0.74 |
| AF347015.2 | -0.66 | -0.74 |
| AF347015.8 | -0.66 | -0.72 |
| mt-cyb | -0.65 | -0.73 |
| AF347015.27 | -0.64 | -0.73 |
| AF347015.33 | -0.64 | -0.72 |
| MT-CO2 | -0.63 | -0.68 |
| SLC6A12 | -0.61 | -0.66 |
| myh14 | -0.60 | -0.68 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 非编码RNA的反应组代谢 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 | 66 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 | 140 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 成熟转录本向细胞质的反应组传输 | 54 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome mRNA处理 | 161 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 源自内在转录本的成熟mRNA的反应组传输 | 33 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SLC介导的跨膜运输 | 241 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome葡萄糖转运 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome NEP NS2与细胞出口机械相互作用 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV感染 | 207 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 核糖核蛋白转运到宿主核的反应组转运 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期 | 125 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome宿主的艾滋病毒因素的相互作用 | 132 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome HIV生命周期的后期 | 104 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VPR与宿主细胞蛋白的反应组相互作用 | 33 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄糖激酶调节蛋白对葡萄糖激酶的反应组调节 | 27 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血早期祖先 | 532 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染10小时DN | 56 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |