基因页：引用

概括？
基因 11113
象征 引用
同义词 Crik | STK21
描述 Citron Rho相互作用丝氨酸/苏氨酸激酶
参考 MIM：605629|HGNC：HGNC：1985|Ensembl：ENSG00000122966|HPRD：09289|Vega：Otthumg00000134325
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q24
Pascal P值 8.51E-4
Sherlock P值 0.687
胎儿β -2.78
DMG 1（＃研究）
主持人 元
支持 细胞内信号转导
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMAN_MGLUR5
G2CDB.HUMANNRC
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
DNM：XU_2012 整个外显子组测序分析 在这项研究中，通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：2
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.1678

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
引用 CHR12 120306864 一个 G NM_001206999
NM_001206999
NM_007174
NM_007174		 。
p.80y> h
。
p.80y> h		 拼接
错过
拼接
错过		 精神分裂症 DNM：XU_2012

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG24889207 12 120124618 引用 5.152E-4 0.526 0.047 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ifi44l 0.82 0.68
PARP9 0.81 0.71
PLSCR1 0.79 0.62
TAP1 0.79 0.59
IRF9 0.75 0.57
ifit3 0.74 0.55
OAS1 0.72 0.49
ifit1 0.71 0.50
HERC5 0.71 0.66
ifitm3 0.71 0.42
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
LMO7 -0.35 -0.35
myt1l -0.35 -0.32
MEF2C -0.34 -0.35
DPP4 -0.34 -0.37
mpped1 -0.34 -0.36
AC079953.2 -0.34 -0.32
SATB2 -0.34 -0.39
LRFN2 -0.34 -0.33
SPTAN1 -0.34 -0.30
klhl1 -0.34 -0.31

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0005083 小型GTPase调节剂活性 IEA -
去：0005524 ATP结合 IEA -
去：0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 IEA -
去：0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 ISS 9792683
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
去：0008270 锌离子结合 IEA -
GO：0017124 SH3域结合 IEA -
GO：0019992 二酰基甘油结合 IEA -
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0048699 神经元的产生 ISS 神经元，神经发生（GO期限：7） 11086988
去：0007399 神经系统的发展 IEA 神经突（GO期限：5） -
去：0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去：0007242 细胞内信号传导级联 IEA -
去：0007049 细胞周期 IEA -
去：0007067 有丝分裂 ISS 11086988
去：0008152 代谢过程 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
去：0030154 细胞分化 IEA -
去：0051301 细胞分裂 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
pid rhoa途径 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson对砷的回应 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Inamura肺癌SCC子类型 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 94 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath循环基因 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1自分泌目标DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变 180 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1靶向 93 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rampon丰富学习环境早期DN 10 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期g2 m 216 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-128 1280 1286 1a HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-138 698 704 M8 HSA-MIR-138脑 Agcugguuguguugaauc
mir-140 1177 1183 M8 HSA-MIR-140脑 agugguuuuacccuaugguag
mir-142-5p 2074 2081 1A，M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-148/152 1119 1125 1a HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152脑 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-181 708 714 1a HSA-MIR-181A脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-221/222 1115 1121 1a HSA-MIR-221脑 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222脑 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-224 1283 1289 M8 HSA-MIR-224 caagucacuaguguguccuuua
mir-25/32/92/363/367 852 858 1a HSA-MIR-25脑 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-27 1280 1286 M8 HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-30-5p 651 657 M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-324-3p 742 749 1A，M8 HSA-MIR-324-3P ccacugccccaggugcugcugg
mir-326 1159 1165 1a HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
mir-328 754 760 1a HSA-MIR-328脑 cuggcccucugccuuccgu
mir-370 2234 2241 1A，M8 HSA-MIR-370脑 gccugggggguggaaccugg
mir-500 1390 1396年 M8 HSA-MIR-500 augcaccuggggaggagauucug
HSA-MIR-500 augcaccuggggaggagauucug