基因页：FAF1
概括？
| 基因 | 11124 |
| 象征 | FAF1 |
| 同义词 | cgi-03 | hfaf1s | ubxd12 | ubxn3a | hfaf1 |
| 描述 | FAS相关因子1 |
| 参考 | MIM：604460|HGNC：HGNC：3578|HPRD：05124| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 133 |
| Pascal P值 | 0.323 |
| Sherlock P值 | 0.773 |
| 胎儿β | 0.773 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG15574895 | 1 | 51133602 | FAF1 | 2.974E-4 | -0.492 | 0.039 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1578978 | CHR8 | 118196802 | FAF1 | 11124 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ERCC2 | 0.88 | 0.87 |
| GPS1 | 0.88 | 0.88 |
| eral1 | 0.88 | 0.85 |
| TMEM115 | 0.88 | 0.86 |
| MCRS1 | 0.87 | 0.85 |
| TMEM180 | 0.87 | 0.87 |
| DMAP1 | 0.87 | 0.86 |
| MRPS2 | 0.87 | 0.87 |
| thap4 | 0.87 | 0.84 |
| TBRG4 | 0.86 | 0.84 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.70 | -0.71 |
| AF347015.8 | -0.69 | -0.66 |
| MT-CO2 | -0.69 | -0.65 |
| AF347015.31 | -0.68 | -0.64 |
| AF347015.27 | -0.67 | -0.66 |
| mt-cyb | -0.67 | -0.65 |
| MT-ATP8 | -0.66 | -0.71 |
| AF347015.2 | -0.65 | -0.61 |
| AF347015.33 | -0.64 | -0.62 |
| AL139819.3 | -0.64 | -0.63 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Biocarta FAS途径 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| St FAS信号通路 | 65 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林格伦膀胱癌群集3 | 329 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tomlins转移 | 14 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TCGA胶质母细胞瘤副本编号DN | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应17 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |