基因页：CHGA

概括？
基因 1113
象征 CHGA
同义词 CGA
描述 铬酸藻蛋白a
参考 MIM：118910|HGNC：HGNC：1929|ENSEMBL：ENSG00000100604|HPRD：07170|Vega：Otthumg00000171225
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q32
Pascal P值 0.203
Sherlock P值 0.966
胎儿β -1.516
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 神经营养蛋白信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 3 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6048101 CHR20 22429986 CHGA 1113 0.13 反式
RS6036116 CHR20 22430349 CHGA 1113 0.16 反式
RS4632416 CHR20 22437090 CHGA 1113 0.11 反式
RS4459793 CHR20 22439811 CHGA 1113 0.15 反式
RS6048112 CHR20 22442814 CHGA 1113 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MAP2K4 0.94 0.92
FAM179B 0.94 0.91
FAM126B 0.94 0.91
NCOA7 0.94 0.91
钟 0.93 0.91
Col4a3bp 0.93 0.92
DPP8 0.93 0.89
ADAM22 0.92 0.90
SYT1 0.92 0.88
钩1 0.92 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
EFEMP2 -0.48 -0.50
Rab34 -0.45 -0.52
EIF4EBP3 -0.43 -0.49
C1orf61 -0.43 -0.58
GATSL3 -0.42 -0.44
DBI -0.42 -0.49
nudt8 -0.41 -0.45
Rab13 -0.39 -0.48
Bcl7c -0.38 -0.39
nkain4 -0.38 -0.47

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0008217 血压调节 塔斯 8406464
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞向上 146 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧素DN的浓凋亡 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
障碍癌复发正常样本 32 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王·巴雷特（Wang Barretts）食道 51 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合DN的Rorie目标 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LSD1目标DN 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson Gamma辐射阻力 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔内B 172 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼时钟目标DN 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
角色glis3目标 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因