基因页面:CAPN11
总结吗?
GeneID | 11131年 |
象征 | CAPN11 |
同义词 | calpain11 |
描述 | calpain 11 |
参考 | MIM: 604822|HGNC: HGNC: 1478|运用:ENSG00000137225|HPRD: 05315|织女:OTTHUMG00000014758 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 6 p12 |
帕斯卡假定值 | 0.006 |
eGene | 皮质 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04433 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs10994209 | chr10 | 61877705 | CAPN11 | 11131年 | 0.05 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CAPN11_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005509 | 钙离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004198 | calcium-dependent cysteine-type肽链内切酶活性 | 助教 | 10409436 | |
去:0008233 | 肽酶的活动 | 助教 | 10409436 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
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BOQUEST干细胞DN | 216年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN WIERENGA STAT5A目标 | 213年 | 127年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |