基因页:TBC1D8
概括?
基因 | 11138 |
象征 | TBC1D8 |
同义词 | ad3 | gramd8 | hblp1 | tbc1d8a | vrp |
描述 | TBC1域家庭成员8 |
参考 | HGNC:HGNC:17791|Ensembl:ENSG00000204634|HPRD:06752|Vega:Otthumg00000153040 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q11.2 |
Pascal P值 | 0.244 |
Sherlock P值 | 0.629 |
胎儿β | -0.824 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0004 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00534380 | 2 | 101766586 | TBC1D8 | 4.555e-4 | 0.398 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TBC1D8_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005097 | RAB GTPase激活剂活性 | IEA | - | |
去:0005096 | GTPase激活剂活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | 塔斯 | 10373574 | |
去:0008015 | 血液循环 | 塔斯 | 10373574 | |
GO:0032313 | RAB GTPase活性的调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | 塔斯 | 10373574 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Schuetz乳腺癌导管侵入性DN | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX FOXO1融合DN的Davicioni目标DN | 68 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dittmer Pthlh靶向 | 112 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2A DN | 141 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee肝癌ACOX1 UP | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc DN | 63 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时DN | 101 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G6 | 153 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JI对FSH的响应 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染6小时DN | 160 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染12小时DN | 101 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUILLETTE CLL 13Q14删除 | 74 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
yague premumor耐药性 | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C D DN | 252 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindstedt树突状细胞成熟C | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 81 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |