基因页：chgb
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| 基因ID | 1114 |
| 象征 | chgb |
| 同义词 | SCG1 |
| 描述 | chromogranin B |
| 参考 | MIM：118920|HGNC：HGNC：1930|Ensembl：ENSG00000089199|HPRD：07512|Vega:OTTHUMG00000031821 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 20p12.3 |
| Pascal P值 | 0.558 |
| Sherlock P值 | 0.47 |
| 胎儿β | -1.661 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
基因in Data Sources
部分即遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS3747518 | CHR2 | 163128724 | chgb | 1114 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TRIM33 | 0.94 | 0.93 |
| IREB2 | 0.94 | 0.96 |
| RSBN1 | 0.93 | 0.95 |
| Med13 | 0.93 | 0.95 |
| ZNF148 | 0.93 | 0.96 |
| KIAA2022 | 0.93 | 0.96 |
| AFF4 | 0.93 | 0.95 |
| SLC38A1 | 0.93 | 0.96 |
| EPM2AIP1 | 0.93 | 0.96 |
| ZNF281 | 0.92 | 0.94 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.66 | -0.85 |
| TSC22D4 | -0.65 | -0.77 |
| AF347015.31 | -0.65 | -0.84 |
| HSD17B14 | -0.65 | -0.77 |
| hepn1 | -0.65 | -0.73 |
| AIFM3 | -0.64 | -0.72 |
| MT-CO2 | -0.64 | -0.85 |
| rom1 | -0.64 | -0.77 |
| S100B | -0.63 | -0.78 |
| serpinb6 | -0.63 | -0.71 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005179 | 激素活性 | 塔斯 | 3608978 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005576 | 细胞外区域 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 阿卡卡 | ACAC |ACC |ACC1 |acca | 乙酰辅酶A羧化酶α | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| atxn2 | atx2 |FLJ46772 |sca2 |TNRC13 | ataxin 2 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| CBFB | PEBP2B | core-binding factor, beta subunit | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| CCDC92 | FLJ22471 | 包含92 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| FGFR3 | ach |CD333 |Cek2 |HSFGFR3EX |JTK4 | 成纤维细胞生长因子受体3 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| GCS1 | - | 葡萄糖酶i | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| 标记3 | ctak1 |KP78 |par1a | 地图/微管亲和调节激酶3 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| mgll | hu-k5 |mgl | 一甘油酸脂肪酶 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| OGG1 | 嗯|hogg1 |mutm |OGH1 | 8-氧气的DNA糖基酶 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| pold1 | cdc2 |pold | 聚合酶（导向DNA），三角洲1，催化亚基125KDA | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| 布拉格明 | DKFZP761P0423 | RND2的大鼠Pragma同源物 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| PTEN | 10q23del |BZS |MGC11227 |姆姆|mmac1 |pten1 |tep1 | 磷酸酶和长素同源物 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| S100A8 | 60b8ag |caga |CFAG |CGLA |CP-10 |l1ag |MA387 |Mif |MRP8 |nif | P8 | S100钙结合蛋白A8 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| SAFB2 | KIAA0138 | 脚手架附着因子B2 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| SLC25A6 | AAC3 |ANT3 |Ant3y |MGC17525 | 溶质载体家族25（线粒体载体；腺嘌呤核苷酸转运剂），成员6 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| 塔兹 | BTHS |CMD3A |efe |efe2 |FLJ27390 |G4.5 |lvncx |taz1 |XAP-2 | 塔法奇 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| tubb2a | TUBB | TUBB2 | dJ40E16.7 | 微管蛋白，β2A | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| TWF2 | A6RP |A6r |MSTP011 |ptk9l | 双胞胎蛋白，肌动蛋白结合蛋白，同源2（果蝇） | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| YLPM1 | C14orf170 |zap |ZAP3 | 包含1的YLP图案 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-544 | 94 | 100 | 1a | HSA-MIR-544 | auucugcauuuuuuagcaagu |