Summary
基因 11151
象征 coro1a
同义词 clabp | clipina | hcoro1 | imd8 |炸玉米饼| p57
描述 冠1A
参考 MIM:605000|HGNC:HGNC:2252|ENSEMBL:ENSG00000102879|HPRD:05414|Vega:Otthumg00000132148
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p11.2
Pascal P值 0.001
Sherlock p-value 0.481
胎儿β -1.015
支持 结构可塑性
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
CompositeSet
潜在的突触基因

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CNV:是的 拷贝数变异研究 Manual curation
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
gsma_iie Genome scan meta-analysis (European-ancestry samples) Psr: 0.01775

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ATP5F1 0.87 0.87
TCEB1 0.86 0.87
SUPT4H1 0.85 0.86
COPS6 0.85 0.84
UQCRH 0.85 0.85
LSM1 0.84 0.82
AC063943.4 0.84 0.84
ZDHHC4 0.84 0.80
VTI1B 0.83 0.81
MRPL46 0.83 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.18 -0.53 -0.40
AF347015.26 -0.52 -0.42
AF347015.2 -0.50 -0.42
GATA2 -0.49 -0.47
FAM38A -0.48 -0.47
PPP1R13L -0.47 -0.42
AF347015.8 -0.47 -0.36
AF347015.15 -0.46 -0.38
tenc1 -0.46 -0.48
DOCK6 -0.46 -0.46

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008022 蛋白C末端结合 IPI 9365277
去:0051015 肌动蛋白丝结合 艾达 7758584|15601263
GO:0042803 蛋白质同构化活性 艾达 15601263
GO:0043548 磷酸肌醇3-激酶结合 艾达 11094157
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001845 phagolysosome formation IMP 12132654
GO:0006928 细胞运动 nas 17341475
去:0030036 肌动蛋白细胞骨架组织 IMP 17442961
去:0051126 肌动蛋白成核的负调节 艾达 17442961
GO:0031589 cell-substrate adhesion IMP 17442961
GO:0050918 positive chemotaxis 艾达 17442961
GO:0045087 先天免疫反应 nas 17341475
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001891 吞噬杯 艾达 17442961
去:0005856 细胞骨架 IEA -
去:0005634 艾达 17341475
去:0005737 cytoplasm 艾达 17341475
GO:0030027 薄片 艾达 17442961
去:0005886 质膜 艾达 17341475|17442961
GO:0031410 细胞质囊泡 IEA -
GO:0031941 丝状肌动蛋白 艾达 15800061
GO:0030864 皮质肌动蛋白细胞骨架 艾达 15800061
GO:0045335 吞噬囊泡 艾达 17442961

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Elvidge缺氧DN 146 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ELVIDGE HYPOXIA BY DMOG DN 59 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Elvidge Hif1a靶向 67 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ELVIDGE HIF1A AND HIF2A TARGETS UP 41 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bidus转移DN 161 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan终端末端芽DN 7 6 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mattioli Mgus vs PCL 116 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dairkee Tert目标 380 213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹MBD目标 957 597 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onder CDH1目标2 DN 464 276 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭葡萄糖剥夺 48 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up 87 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sasaki成人T细胞白血病 176 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SANSOM APC TARGETS DN 366 238 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2 UP 66 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MATSUDA NATURAL KILLER DIFFERENTIATION 475 313 All SZGR 2.0 genes in this pathway
整合素信号传导 59 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lenaour树突状细胞成熟DN 128 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lu衰老的脑dn 153 120 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ramalho茎DN 74 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CUI TCF21目标2 DN 830 547 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 All SZGR 2.0 genes in this pathway
江缺氧正常 311 205 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RAMPON晚丰富的学习环境 22 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
道格拉斯BMI1靶向 566 371 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伽玛辐射8G后的生存率不佳 95 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伽玛辐射2G后的生存率不佳 171 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌正常 476 285 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 All SZGR 2.0 genes in this pathway
公园APL发病机理DN 50 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEE DIFFERENTIATING T LYMPHOCYTE 200 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
陈代谢综合征网络 1210 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MEISSNER ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 14 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain ICP带有H3K4ME3 32 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Valk AML群集6 33 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 74 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MEF ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 38 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARSON FOXP3目标 66 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 137 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wierenga Stat5a靶向DN 213 127 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Delpuech FOXO3靶向 68 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2目标 745 475 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向 682 433 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PEDRIOLI MIR31 TARGETS UP 221 120 All SZGR 2.0 genes in this pathway
寄养KDM1A靶向DN 211 119 All SZGR 2.0 genes in this pathway