基因页:coro1a
Summary?
基因 | 11151 |
象征 | coro1a |
同义词 | clabp | clipina | hcoro1 | imd8 |炸玉米饼| p57 |
描述 | 冠1A |
参考 | MIM:605000|HGNC:HGNC:2252|ENSEMBL:ENSG00000102879|HPRD:05414|Vega:Otthumg00000132148 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p11.2 |
Pascal P值 | 0.001 |
Sherlock p-value | 0.481 |
胎儿β | -1.015 |
支持 | 结构可塑性 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL CompositeSet 潜在的突触基因 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | Manual curation | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
gsma_iie | Genome scan meta-analysis (European-ancestry samples) | Psr: 0.01775 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CORO1A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ATP5F1 | 0.87 | 0.87 |
TCEB1 | 0.86 | 0.87 |
SUPT4H1 | 0.85 | 0.86 |
COPS6 | 0.85 | 0.84 |
UQCRH | 0.85 | 0.85 |
LSM1 | 0.84 | 0.82 |
AC063943.4 | 0.84 | 0.84 |
ZDHHC4 | 0.84 | 0.80 |
VTI1B | 0.83 | 0.81 |
MRPL46 | 0.83 | 0.79 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.18 | -0.53 | -0.40 |
AF347015.26 | -0.52 | -0.42 |
AF347015.2 | -0.50 | -0.42 |
GATA2 | -0.49 | -0.47 |
FAM38A | -0.48 | -0.47 |
PPP1R13L | -0.47 | -0.42 |
AF347015.8 | -0.47 | -0.36 |
AF347015.15 | -0.46 | -0.38 |
tenc1 | -0.46 | -0.48 |
DOCK6 | -0.46 | -0.46 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008022 | 蛋白C末端结合 | IPI | 9365277 | |
去:0051015 | 肌动蛋白丝结合 | 艾达 | 7758584|15601263 | |
GO:0042803 | 蛋白质同构化活性 | 艾达 | 15601263 | |
GO:0043548 | 磷酸肌醇3-激酶结合 | 艾达 | 11094157 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001845 | phagolysosome formation | IMP | 12132654 | |
GO:0006928 | 细胞运动 | nas | 17341475 | |
去:0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | IMP | 17442961 | |
去:0051126 | 肌动蛋白成核的负调节 | 艾达 | 17442961 | |
GO:0031589 | cell-substrate adhesion | IMP | 17442961 | |
GO:0050918 | positive chemotaxis | 艾达 | 17442961 | |
GO:0045087 | 先天免疫反应 | nas | 17341475 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001891 | 吞噬杯 | 艾达 | 17442961 | |
去:0005856 | 细胞骨架 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 17341475 | |
去:0005737 | cytoplasm | 艾达 | 17341475 | |
GO:0030027 | 薄片 | 艾达 | 17442961 | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 17341475|17442961 | |
GO:0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - | |
GO:0031941 | 丝状肌动蛋白 | 艾达 | 15800061 | |
GO:0030864 | 皮质肌动蛋白细胞骨架 | 艾达 | 15800061 | |
GO:0045335 | 吞噬囊泡 | 艾达 | 17442961 |