基因页:AP4S1
概括?
基因 | 11154 |
象征 | AP4S1 |
同义词 | ap47b | cla20 | claps4 | cpsq6 | spg52 |
描述 | 适配器相关的蛋白质复合物4 Sigma 1亚基 |
参考 | MIM:607243|HGNC:HGNC:575|ENSEMBL:ENSG00000100478|HPRD:06257|Vega:Otthumg00000140202 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q12 |
Pascal P值 | 0.038 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.047 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC100788.1 | 0.43 | 0.31 |
AC018638.5 | 0.41 | 0.43 |
AC078942.1 | 0.41 | 0.40 |
RP11-413E6.1 | 0.40 | 0.15 |
NUP210L | 0.40 | 0.29 |
AC092143.1 | 0.40 | 0.37 |
CYP2D6 | 0.40 | 0.39 |
AC004490.1 | 0.40 | 0.34 |
AC024580.1 | 0.40 | 0.31 |
AGAP5 | 0.39 | 0.35 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TMEM126A | -0.31 | -0.34 |
C18orf32 | -0.31 | -0.43 |
AL450342.5 | -0.30 | -0.33 |
SDHB | -0.30 | -0.35 |
Selt | -0.30 | -0.36 |
NDUFV2 | -0.30 | -0.34 |
TMEM70 | -0.30 | -0.35 |
丝 | -0.30 | -0.31 |
gabarapl2 | -0.29 | -0.30 |
ARMC10 | -0.29 | -0.31 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | 塔斯 | 10436028 | |
去:0008565 | 蛋白质转运蛋白活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006886 | 细胞内蛋白转运 | IEA | - | |
GO:0016192 | 囊泡介导的运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0030117 | 膜外套 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
去:0005905 | 涂层坑 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg溶酶体 | 121 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Scibetta KDM5B靶向DN | 81 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛克伍德在肺癌中放大 | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iglesias E2F目标 | 151 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时DN | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC的反应 | 123 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇10的时间反应10 | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |