基因页:Adamts6
概括?
基因 | 11174 |
象征 | Adamts6 |
同义词 | Adam-TS 6 | Adam-TS6 | Adamts-6 |
描述 | Adam金属肽酶,具有血小板素1型基序6 |
参考 | MIM:605008|HGNC:HGNC:222|Ensembl:ENSG0000000049192|HPRD:05421|Vega:Otthumg0000000074079 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q12 |
Pascal P值 | 0.007 |
胎儿β | 1.408 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Adamts6 | CHR5 | 64466464 | G | t | NM_197941 | p.1075t> n | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | Adamts6 | 11174 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA0101 | 0.97 | 0.73 |
CCNB2 | 0.97 | 0.80 |
Birc5 | 0.96 | 0.81 |
CCNA2 | 0.96 | 0.76 |
RRM2 | 0.96 | 0.80 |
RAD51 | 0.96 | 0.72 |
bub1 | 0.95 | 0.81 |
PBK | 0.95 | 0.76 |
梅尔克 | 0.95 | 0.79 |
Neil3 | 0.95 | 0.74 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FBXO2 | -0.43 | -0.67 |
HLA-F | -0.43 | -0.69 |
C5orf53 | -0.42 | -0.67 |
pth1r | -0.41 | -0.65 |
asphd1 | -0.41 | -0.57 |
SLC9A3R2 | -0.41 | -0.51 |
AIFM3 | -0.41 | -0.67 |
tinagl1 | -0.40 | -0.68 |
aldoc | -0.40 | -0.65 |
AF347015.27 | -0.40 | -0.73 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
HOOI ST7靶向 | 94 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC2靶向 | 114 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
石匠食道癌发生 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P7 | 90 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OUILLETTE CLL 13Q14删除DN | 60 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Le滑雪目标 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克里希南·弗林(Krishnan Furin)靶向DN | 13 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM监管机构 | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |