概括
基因 11174
象征 Adamts6
同义词 Adam-TS 6 | Adam-TS6 | Adamts-6
描述 Adam金属肽酶,具有血小板素1型基序6
参考 MIM:605008|HGNC:HGNC:222|Ensembl:ENSG0000000049192|HPRD:05421|Vega:Otthumg0000000074079
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q12
Pascal P值 0.007
胎儿β 1.408
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
Adamts6 CHR5 64466464 G t NM_197941 p.1075t> n 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 Adamts6 11174 0.2 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA0101 0.97 0.73
CCNB2 0.97 0.80
Birc5 0.96 0.81
CCNA2 0.96 0.76
RRM2 0.96 0.80
RAD51 0.96 0.72
bub1 0.95 0.81
PBK 0.95 0.76
梅尔克 0.95 0.79
Neil3 0.95 0.74
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FBXO2 -0.43 -0.67
HLA-F -0.43 -0.69
C5orf53 -0.42 -0.67
pth1r -0.41 -0.65
asphd1 -0.41 -0.57
SLC9A3R2 -0.41 -0.51
AIFM3 -0.41 -0.67
tinagl1 -0.40 -0.68
aldoc -0.40 -0.65
AF347015.27 -0.40 -0.73

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
HOOI ST7靶向 94 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向 114 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
石匠食道癌发生 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P7 90 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUILLETTE CLL 13Q14删除DN 60 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Le滑雪目标 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克里希南·弗林(Krishnan Furin)靶向DN 13 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标增长 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM监管机构 238 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因